基底细胞亚群作为预测食管癌新辅助治疗疗效的生物标志物

《Journal of Cancer Research and Clinical Oncology》：Basal cell subsets, as biomarker to predict the therapeutic effect of neoadjuvant therapy for esophageal carcinoma

【字体：大中小】 时间：2026年05月20日 来源：Journal of Cancer Research and Clinical Oncology 2.8

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　　摘要背景目前，术前新辅助治疗在食管癌（ESCA）中具有重要的应用前景。然而，目前仍缺乏有效的生物标志物来预测食管癌新辅助治疗的预后。方法我们分析了22名II期至IV期食管癌（ESCA）患者的肿瘤及其配对邻近组织（21例ESCC和1例食管腺鳞癌，EASC），这些患者均在唐都医院接受

摘要

背景

目前，术前新辅助治疗在食管癌（ESCA）中具有重要的应用前景。然而，目前仍缺乏有效的生物标志物来预测食管癌新辅助治疗的预后。

方法

我们分析了22名II期至IV期食管癌（ESCA）患者的肿瘤及其配对邻近组织（21例ESCC和1例食管腺鳞癌，EASC），这些患者均在唐都医院接受了新辅助化疗-免疫治疗（抗PD-1抗体联合铂类药物和白蛋白结合型紫杉醇）。使用R语言包“CellChat”来分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的细胞间通讯。通过“Seurat”识别并量化基底细胞亚群，并计算其与病理反应的相关性。利用“Seurat”识别差异表达基因（DEGs），并使用TIMER数据库进一步注释了27个非冗余的DEGs。

结果

研究发现，在不完全病理反应（IPR）、主要病理反应（MPR）和完全病理反应（pCR）中，基底细胞与其他细胞之间的细胞间通讯逐渐减弱。具体而言，Basal3和Basal8亚群与pCR具有强相关性，而Basal7亚群与IPR高度相关。对这些亚群中排名前10的基因进行进一步分析后发现，ATF3和JUN对食管癌患者的生存有影响。

结论

总之，我们的研究发现了接受新辅助治疗的食管癌患者中不同基底细胞亚群的细胞特征，发现疗效较差的亚群是Basal7，而疗效较好的亚群是Basal3和Basal8，这为未来食管癌的新辅助治疗提供了潜在的生物标志物。

背景

目前，术前新辅助治疗在食管癌（ESCA）中具有重要的应用前景。然而，目前仍缺乏有效的生物标志物来预测食管癌新辅助治疗的预后。

方法

我们分析了22名II期至IV期食管癌（ESCA）患者的肿瘤及其配对邻近组织（21例ESCC和1例食管腺鳞癌，EASC），这些患者均在唐都医院接受了新辅助化疗-免疫治疗（抗PD-1抗体联合铂类药物和白蛋白结合型紫杉醇）。使用R语言包“CellChat”来分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的细胞间通讯。通过“Seurat”识别并量化基底细胞亚群，并计算其与病理反应的相关性。利用“Seurat”识别差异表达基因（DEGs），并使用TIMER数据库进一步注释了27个非冗余的DEGs。

结果

研究发现，在不完全病理反应（IPR）、主要病理反应（MPR）和完全病理反应（pCR）中，基底细胞与其他细胞之间的细胞间通讯逐渐减弱。具体而言，Basal3和Basal8亚群与pCR具有强相关性，而Basal7亚群与IPR高度相关。对这些亚群中排名前10的基因进行进一步分析后发现，ATF3和JUN对食管癌患者的生存有影响。