《MAGNETIC RESONANCE IN MEDICINE》:Single-Shot 2D Radial Echo Planar Imaging for Functional MRI
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目的:开发一种新型的单次激发径向平面回波成像(ss-rEPI,single-shot radial Echo Planar Imaging)技术,用于功能性磁共振成像(fMRI,functional MRI)实验中的快速、无畸变大脑成像。
方法:研究人员在3T
目的:开发一种新型的单次激发径向平面回波成像(ss-rEPI,single-shot radial Echo Planar Imaging)技术,用于功能性磁共振成像(fMRI,functional MRI)实验中的快速、无畸变大脑成像。
方法:研究人员在3T临床扫描仪上采用带有小黄金角(small golden-angle)旋转的2D ss-rEPI读出采集径向多梯度回波(radial mGRE,radial multi-gradient echo)数据。图像重建采用迭代共轭梯度(iterative conjugate-gradient)方法,并结合了线圈灵敏度、B0场不均匀性、横向弛豫以及场漂移校正,以解决扩展mGRE读out中的信号不一致问题。在重建前附加的k空间加权图像对比(KWIC,k-space-weighted image contrast)滤波有助于减少低频空间频率下的模型失配。研究人员评估了单次激发rEPI的图像质量、对比度和畸变,并与多激发径向mGRE参考数据进行了对比。通过重建中KWIC滤波和目标回波时间(TE,Echo Time)的回顾性调整,研究人员能够从单次ss-rEPI扫描中生成多幅T2加权和相位对比图像,从而实现定量T2映射和定量磁化率图(QSM,Quantitative Susceptibility Mapping)。研究人员进行了视觉血氧水平依赖(BOLD,Blood Oxygen Level Dependent)fMRI实验,并与笛卡尔平面回波成像(Cartesian EPI)测量结果进行了评估。
结果:研究人员以低于1.7秒的采集时间,获得了面内分辨率为2×2和1.5 mm2(斜坡采样)的24层3 mm厚无畸变、多对比度大脑图像。在两名受试者的多场次fMRI实验中,ss-rEPI展示了与标准EPI相当的视觉皮层BOLD激活,同时也实现了功能性T2*测量。
结论:单次激发rEPI能够实现快速、无畸变的2D多对比度大脑成像,为笛卡尔EPI提供了一种有前景的替代方案。准确的ΔB0建模对于ss-rEPI的性能至关重要。先进的重建技术和自校准方法可以进一步增强其速度、性能以及在各种MRI技术中的适用性。
用于功能性磁共振成像的单次激发二维径向平面回波成像(ss-rEPI)研究解读
本文介绍了一种名为单次激发径向平面回波成像(ss-rEPI, single-shot radial Echo Planar Imaging)的新型磁共振成像技术,该技术旨在解决传统笛卡尔平面回波成像(Cartesian EPI)在功能性磁共振成像(fMRI, functional MRI)中常见的磁敏感伪影和几何畸变问题。目前,EPI虽因其高速采集能力而被广泛用于fMRI和扩散张量成像,但其基本实现常因扩展读out期间的相位积累而导致沿相位编码方向的磁敏感伪影和非线性畸变。尽管已有基于ΔB0场映射和配准的缓解方法,以及回声平面时间分辨成像(EPTI)等技术,但径向采样策略(如径向EPI,即rEPI)因其对运动的鲁棒性、无畸变成像能力及非相干欠采样特性,提供了另一种思路。然而,过往rEPI的发展受限于长回波链读out期间的信号演变导致的相位不一致,进而引起信号丢失和图像质量差。本研究通过结合特定的轨迹设计、滤波策略和基于模型的重建方法,重新探讨了ss-rEPI的可行性,并成功将其应用于快速、无畸变的多对比度大脑成像及fMRI。该论文发表于《MAGNETIC RESONANCE IN MEDICINE》期刊。
为开展此项研究,研究人员主要采用了以下关键技术方法:在3T MRI扫描仪(Siemens MAGNETOM Prisma)上,使用52通道头线圈对两个健康志愿者及球体模体进行数据采集;采用基于小黄金角(27.198...°)旋转的2D ss-rEPI序列进行径向多梯度回波(mGRE)数据采样,并使用广义斐波那契数列设计轨迹和KWIC(k-space-weighted image contrast)滤波分段;图像重建基于Matlab平台离线进行,采用迭代共轭梯度SENSE(Sensitivity Encoding)重建框架,模型中纳入了线圈灵敏度、B0场不均匀性(ΔB0)、横向弛豫(R2)及场漂移校正,并利用单独的mGRE预扫获取初始场图、R2图及线圈灵敏度图(ESPIRiT),此外还应用了主成分分析(PCA)进行多线圈数据压缩和总变分(TV)约束。
研究结果如下:
4.1 利用KWIC滤波和基于模型重建缓解ss-rEPI中的相位不一致
k空间模拟和使用未滤波ss-rEPI轨迹的实验均显示,该方法对B0不均匀性高度敏感,会导致严重信号丢失;而R2弛豫主要调节图像对比度。应用KWIC滤波可大幅减少这些伪影,较窄的滤波器(如K4)比较宽的滤波器(如K1)产生更少的ΔB0相关误差。实验证实,仅使用KWIC滤波可减少信号丢失和离共振伪影,但残留伪影依然存在;而完整的基于模型重建(包含ΔB0和R2项)能显著改善图像质量,甚至在无KWIC滤波的情况下也能大幅减少可见伪影。不过,无KWIC滤波及使用最宽滤波器K1时,在较晚回波时间下会出现对比度丢失和模糊增加。滤波器K2-K4在伪影减少和信噪比(SNR)保持之间提供了最佳平衡。
4.2 单次激发rEPI的多对比图像及定量T2*和磁化率图
研究人员以低于1.7秒的采集时间获取了24层分辨率为2×2×3 mm3的大脑图像,并与径向mGRE参考图像对比,关键解剖特征在各回波时间下均得以保留,且无 apparent畸变。利用多对比ss-rEPI图像,研究人员推导了定量T2图和QSM图。与mGRE参考相比,ss-rEPI的T2映射略微高估了大脑的T2值(RMSE=8.9 ms),而在高T2值和受离共振效应影响的区域差异较大;QSM图噪声有所增加,但与mGRE参考匹配密切(RMSE=0.0173 ppm)。
4.3 场漂移校正
由于ss-rEPI依赖准确的B0不均匀性估计,研究人员利用rEPI扫描本身的多回波k0相位信息实施了回顾性场漂移校正。k0频率衍生的频率漂移(Δf)与场图间的差异匹配良好(平均值17.5 vs 17.6 Hz)。校正后的图像在长时间ss-rEPI采集中显示出最小的退化,证明了该方法的有效性。
4.4 功能性MRI实验
研究人员在两名志愿者上进行了BOLD fMRI实验(闪烁棋盘范式),并与匹配参数的标准笛卡尔EPI对比。ss-rEPI在视觉皮层观察到了激活模式,T2加权(T2w)BOLD分析的激活图空间细节清晰,与EPI紧密对齐,潜在的模糊效应较小。T2*映射得出的激活图空间细节虽未完全解析,但激活依然强烈。来自六次MRI session的分析显示ss-rEPI与EPI性能相当,笛卡尔EPI的激活略强,但ss-rEPI的时间信噪比(tSNR)显著更高。不同KWIC滤波器设计的比较显示K2-K4的BOLD激活相似,且显著高于无KWIC滤波的情况;tSNR在所有KWIC滤波和无滤波情况下相当。ss-rEPI与TOPUP校正的EPI之间图像畸变差异很小。
4.5 扩展至斜坡采样ss-rEPI
通过纳入梯度斜坡和blip采样数据(斜坡采样,rs ss-rEPI),研究人员将成像分辨率提升至1.5×1.5 mm2。相比标准ss-rEPI,分辨率提高了22%,揭示了此前2×2 mm2下未解析的细节。尽管fMRI时间序列的tSNR有所降低,但rs ss-rEPI在任务fMRI中仍显示出强烈激活,水平仅略低于2×2 mm2的标准ss-rEPI。
讨论部分总结:
研究指出,径向EPI结合了径向采样的优势与快速梯度回波成像,是笛卡尔EPI的有力替代方案。本研究聚焦于单次激发rEPI,并通过结合KWIC滤波、黄金角排序及基于模型的重建(考虑B0不均匀性和R2弛豫),缓解了中心k空间重复采样带来的挑战,并将ss-rEPI从快速成像拓展至多对比成像。小黄金角旋转与KWIC滤波的整合使得回顾性目标不同回波时间成为可能。基于模型的重建成功捕捉了长单次激发读out期间的主要信号演变,实现了无畸变的T2加权图像、相位图像、T2*映射及QSM,并在BOLD fMRI中产生了与笛卡尔EPI相当的激活。不过,当前实现依赖单独的预扫描来获取固定场图等参数,可能在长时间fMRI中因运动或场漂移引起不一致;未来工作应致力于更高级的重建技术(如子空间重建)及自校准方法,以动态调整参数甚至避免使用预扫描,从而提升该技术在fMRI以外应用中的意义。
结论翻译:
在本研究中,研究人员重新审视并扩展了单次激发rEPI的概念,通过实施一种多层方法实现了高质量的单次激发成像。研究采用了诸如k空间均匀回波时间加权、KWIC滤波等采样考量,并与基于模型的重建相结合,以应对多回波读out期间的相位演变和T2弛豫。每一环节都有助于图像形成的稳定性和完整性,并对该方法在fMRI应用中的成功至关重要。这种新型单次激发rEPI方法能够实现快速无畸变的2D成像,并具备从单一数据集中调整R2对比度的灵活性,展示了ss-rEPI作为快速、多对比度成像替代方案的潜力。然而,该技术的进一步发展,特别是朝向自校准方向,对于提升ss-rEPI在其他成像应用中的意义是值得期待的。