HLGen分子分类系统的建立。A、图形总结…… 可供购买

《Cancer Discovery》：Establishment of HLGen molecular classification system. A, Graphical summ... Available to Purchase

　　

摘要

经典霍奇金淋巴瘤（cHL）的组织结构在各种癌症中是独特的，其特征是罕见的恶性霍奇金细胞和里德-斯特恩伯格细胞与肿瘤微环境（TME）中的复杂免疫细胞生态系统共同进化。由于缺乏全面的系统级研究，目前还难以描述疾病的异质性和具有临床意义的分子亚型。在这项研究中，我们采用了一种综合的多模态方法，通过恶性细胞测序、空间转录组学和成像质谱技术来表征cHL肿瘤。我们发现了四种分子亚型（CST、CN913、STB和CN2P），每种亚型都具有不同的临床特征、突变模式、恶性细胞基因表达谱以及与免疫细胞群体的空间结构。对CST亚型特征性突变CSF2RB的功能建模揭示了失调的致癌信号传导和独特的TME相互作用。这些发现强调了多维度分析在阐明驱动免疫生态系统变化的分子机制以及潜在治疗靶点方面的重要性。

意义：

我们对霍奇金淋巴瘤进行的系统性和全面的基因组及空间解析分析揭示了遗传疾病亚型与TME组成和功能之间的重要关联。了解由突变驱动的细胞因子信号传导失调机制将为干扰癌症中的致癌信号传导和细胞生态系统的治疗干预措施铺平道路。

数据可用性

本研究中描述的原始测序数据已存入欧洲基因组-表型档案（EGAS00001008064），也可应作者要求提供。我们的分子分类系统“HLGen”可在https://shiny.bcgsc.ca/HLGen/获取。IMC数据可在https://zenodo.org/records/15530857获取。本研究使用的主要代码可通过GitHub获取（https://github.com/LCR-BCCRC/CHL_LMD）。