基于COF的光催化人工酶辅助的天然产物提取物中活性成分的精准分析

《Talanta》:COF-Derived Photocatalytic Artificial Enzymes-Assisted Precision Analysis of Active Ingredients in Natural Product Extracts

【字体: 时间:2026年05月20日 来源:Talanta 6.1

编辑推荐:

  阮梅|惠媛|刘全霞|张淑贤|范晓轩|杨玲玲|刘克帅|赵婉燕|何欣|王静|马学勤|陈国宁教育部六盘山地区药用资源保护、开发与利用重点实验室,宁夏医科大学药学院,中国银川750004摘要从复杂天然产物中发现活性成分仍然是药物开发中的一个关键挑战,主要是由于缺乏快速而精确的生物活性化合

  
阮梅|惠媛|刘全霞|张淑贤|范晓轩|杨玲玲|刘克帅|赵婉燕|何欣|王静|马学勤|陈国宁
教育部六盘山地区药用资源保护、开发与利用重点实验室,宁夏医科大学药学院,中国银川750004

摘要

从复杂天然产物中发现活性成分仍然是药物开发中的一个关键挑战,主要是由于缺乏快速而精确的生物活性化合物筛选分析工具。为了解决这一挑战,我们开发了一种基于生物传感技术的计算机辅助筛选策略。我们合成了一种共价有机框架(COF)衍生的光催化人工氧化酶,在自然光激发下对TMB具有强大的催化能力。利用熊果苷作为显色底物,开发了一种灵敏的生物传感检测方法,用于检测α-葡萄糖苷酶(α-Glu)的活性,其线性范围为2-30 μg/mL,从而能够精确筛选出复杂天然提取物中的活性抑制剂。该方法成功从25种天然产物候选物中鉴定出了具有生物活性的提取物。随后,结合计算机辅助的虚拟筛选技术,快速分离并表征了两种活性单体(Honokiol和Magnolol),其对α-Glu的IC50值分别为175 ± 5.62 μM和991.9 ± 36.5 μM。这些活性单体对α-Glu表现出显著的抑制作用。与传统方法相比,基于生物传感的策略有效限制了分析范围并减少了假阳性结果,而计算方法显著提高了活性单体的鉴定和分析效率。本研究为在复杂系统中高效准确地发现生物活性化合物提供了一种新策略,对高通量药物筛选具有广阔的应用前景。

引言

药物筛选是药物发现的关键步骤[1]。快速识别活性化合物可以大大减少药物开发的时间和成本[2],[3],[4]。一些成功的例子表明,包括植物、微生物和海洋生物在内的复杂天然产物系统是发现先导化合物的重要来源[5],[6],[7]。然而,从天然产物中筛选药物常常面临缺乏准确方法的挑战,导致筛选效率低下以及可能出现假阳性或假阴性结果[8],[9]。因此,建立一种从复杂系统中筛选药物的有效方法既至关重要又极具挑战性[10],[11],[12]。
生物传感技术是一种快速、灵敏、特异性强且通常成本效益高的分析方法,能够弥补传统分析方法的局限性[13],[14],[15],[16]。生物传感器能够快速、高通量地筛选大量化合物,从而识别出对特定生物靶标(如酶和受体)具有活性的分子[17]。这使得它们成为在复杂系统中进行药物发现的高通量筛选技术的可行选择[18],[19],[20]。先进生物传感器的发展得益于各种新型材料的探索[21],[22],[23]。近年来,共价有机框架(COFs)引起了广泛关注[24],[25],[26],[27]。通过共价键将预设计的构建块精确组装成COFs,可以实现原子级别的控制[28],从而可定制孔径、拓扑结构和官能团,以实现特定的分析物识别和提高传感器的选择性。因此,COFs已成为生物传感应用中的主流选择,旨在提升传感器的性能[29],[30]。尽管生物传感技术可以快速识别复杂系统中生物活性化合物的存在,但要有效区分导致这些效果的特定活性物质仍然具有挑战性。
计算机辅助的虚拟筛选是识别“命中化合物”和“先导化合物”的有效工具[31],[32]。利用目标信息(如蛋白质结构)或已知的活性配体有助于快速识别复杂系统中的潜在生物活性分子[33],[34]。然而,计算机辅助的虚拟筛选依赖于计算模型和评分函数的准确性,这可能导致一定比例的假阳性或假阴性结果[35],[36]。在分子对接中使用评分函数在准确预测结合亲和力方面仍存在困难,从而阻碍了实验数据的完全替代[37]。
在本研究中,为了高效快速地筛选复杂系统中的酶抑制剂,建立了一个基于生物传感技术的计算机辅助筛选系统。该系统利用COFs作为生物传感器识别元件,快速识别抑制剂的存在。计算机辅助的虚拟筛选技术有助于快速且经济高效地分离活性单体,弥补了生物传感器无法准确筛选单个单体的不足。为了验证该技术的实用性,我们对α-葡萄糖苷酶(α-Glu)进行了研究,这种酶催化寡糖水解为葡萄糖,在碳水化合物消化中起着关键作用[38]。其活性的异常与糖尿病的发生和发展密切相关[39],[40]。α-Glu抑制剂可以抑制肠道中的α-Glu活性,延缓碳水化合物的消化,降低餐后血糖峰值,具有重要的临床应用价值[41],[42]。因此,筛选α-Glu抑制剂具有重要意义。如图1所示,合成了一种具有氧化酶活性的共价有机框架(TpBpy COF)。该COF在可见光照射下表现出优异的氧化酶样活性,并通过光生电子转移产生超氧自由基(·O2?)[43]。在可见光照射下,TpBpy COF能有效将无色底物(TMB)氧化为蓝色氧化态TMB(oxTMB)。α-熊果苷(α-arb)被α-Glu水解产生的氢醌可以还原oxTMB为TMB。通过检测TMB的颜色变化来检测α-Glu的活性。随后,使用该传感器筛选对α-Glu具有抑制作用的天然产物,并结合虚拟筛选进一步准确鉴定具体的活性成分。

章节片段

TpBpy COF的光催化氧化酶活性

在光照条件下,使用3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)作为显色底物,评估了TpBpy COF纳米酶的催化活性[44],[45]。将400 μL TMB(100 μg/mL)、400 μL COF分散液(200 μg/mL)和200 μL PBS缓冲液(10 mM, pH 7.4)充分混合后,置于10 W白光LED下照射10分钟。立即收集上清液,并在652 nm处测量吸光度。在自由基清除实验中,使用200 μL(100 μg/mL)

TpBpy COF的合成与表征

如图2A所示,TpBpy COF在室温下合成,使用离子液体[BmiN(CN)?]作为催化剂,2,4,6-三甲基间苯二酚和[2,2'-联吡啶]-5,5'-二胺作为起始材料。所得到的TpBpy COF呈现纳米棒状聚集体。透射电子显微镜观察到这些棒状结构堆叠在一起(图2B和C)。COF表面的空腔结构提供了大量的反应位点

结论

总之,成功建立了一种集成的基于生物传感技术的计算机辅助筛选策略,用于捕获和鉴定α-Glu的抑制剂。TpBpy COF表现出光催化氧化酶样活性,可作为生物传感系统中的催化介质,无需依赖天然酶。基于TpBpy COF的生物传感系统表现出优异的选择性和抗干扰能力,能够快速可靠地识别活性成分

CRediT作者贡献声明

王静:撰写 – 审稿与编辑、监督、项目管理。马学勤:撰写 – 审稿与编辑、验证、研究、资金获取。陈国宁:撰写 – 审稿与编辑、验证、监督、项目管理、资金获取。阮梅:撰写 – 审稿与编辑、初稿撰写、验证、研究、数据分析、概念化。惠媛:撰写 – 审稿与编辑、研究、数据管理。杨玲玲:

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

本研究的数据可应要求向相应作者索取。

利益冲突声明

作者声明没有已知的财务利益或个人关系可能影响本文的研究结果。

致谢

本研究得到了国家自然科学基金(编号:82360684)、宁夏自然科学基金(编号:2025AAC040008)的支持,以及宁夏医科大学(项目编号:XJKF240330)的公开竞争机制选拔关键研究项目的支持,还有宁夏医科大学(项目编号:XT2022022)的研究项目支持。作者感谢宁夏医科大学医学科技研究中心在实验中提供的宝贵帮助。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号