LGI-1自身免疫性脑炎中的血浆蛋白质组

《Journal of Neuroinflammation》：Plasma proteome in LGI-1 autoimmune encephalitis

　　

摘要

背景

富含亮氨酸的胶质瘤失活抗体相关自身免疫性脑炎（LGI-1 AE）是一种罕见的免疫介导的神经炎症性疾病，会导致癫痫发作和认知功能障碍。LGI-1 AE 对免疫疗法反应良好，然而尽管接受了治疗，残留症状（尤其是认知功能障碍）仍可能持续存在。

我们之前已经发现，在疾病的慢性阶段，LGI-1 AE 患者的外周先天免疫细胞（单核细胞）存在异常。为了进一步了解这些外周变化，我们对处于疾病急性期和慢性期的 LGI-1 AE 患者的血浆进行了蛋白质组学分析。

方法

使用 SomaLogic 11 k 蛋白质组学面板，对 9 名急性期 LGI-1 AE 患者和 27 名慢性期 LGI-1 AE 患者以及 16 名年龄和性别匹配的对照组患者的血浆样本进行了高通量蛋白质组学分析。通过 limma 方法鉴定差异表达蛋白（DEP），假发现率（FDR）< 0.05。对 10 名慢性期 LGI-1 AE 患者和 28 名对照组患者的分离单核细胞进行了批量 RNA 测序。使用 DESeq2 方法进行了差异基因分析，FDR < 0.1。通过对转录组和蛋白质组数据集进行通路分析，并利用 Gene Ontology 生物过程数据库进行了基因集富集分析，FDR < 0.05。

结果

血浆分析显示，与健康对照组相比，急性期组中有 215 种蛋白质表达上调，1015 种蛋白质表达下调。上调的蛋白质包括与先天免疫激活相关的蛋白质、髓系细胞的化学趋化因子、补体级联反应的成分以及淋巴细胞信号传导和激活分子。显著下调的通路包括与自噬相关的通路。急性期组与慢性期组或慢性期组与对照组之间没有显著差异表达的蛋白质（DEP）。单核细胞转录组分析显示有 18 个基因上调和 170 个基因下调，表明白细胞介素（IL）-6 及其下游信号通路是关键的失调通路。

结论

本研究确定了 IL-6 信号传导和终末补体级联反应的激活作为潜在的病理生理免疫机制，这为使用现有药物重新开发治疗方法提供了可能性。此外，观察到的自噬相关通路的抑制表明了一种之前未被充分认识的机制，该机制可能参与了 LGI-1 AE 相关的中枢神经系统自身免疫的发病机制，值得进一步研究自噬失调在其中的作用。