单细胞分析识别出内皮血管血栓形成的特征，这些特征可作为预测癌症患者对免疫疗法反应及生存率的指标

《Journal of Thrombosis and Haemostasis》：Single-Cell Analysis Identifies Endothelial VTE Signatures as Predictors of Immunotherapy Resistance and Survival across Cancers

洪雅关|彭菊丽|肖彤丽|贾柳|华瑞石|费菲郭|寿奎胡

中国郑州郑州大学附属郑州中心医院临床实验室

摘要

背景

静脉血栓栓塞（VTE）是癌症患者的主要并发症，然而肿瘤相关内皮细胞驱动血栓形成和免疫逃逸的转录机制仍不甚明了。

目的

研究肿瘤微环境（TME）中与VTE相关的转录特征，识别内皮细胞特异性的风险基因，并开发一个将高凝状态、免疫功能障碍和肿瘤进展联系起来的预后模型。

方法

我们系统分析了来自多种肿瘤类型的38个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，以表征肿瘤微环境（TME）中与VTE相关的基因表达。内皮细胞被确定为VTE转录特征的主要携带者。在单细胞水平上计算了VTE评分，以描述高风险内皮细胞亚群。通过功能注释、细胞间通信分析和免疫谱分析来评估这些基因的表型和免疫学作用。基于TCGA和GEO的大规模RNA-seq数据集，构建了一个内皮来源的VTE分子模型（Endo.VTM）。还进行了CRISPR/Cas9依赖性筛选。

结果

具有高VTE评分的内皮细胞表现出与凝血、免疫抑制和细胞间信号传导改变相关的转录程序。Endo.VTM包含12个核心基因，在多种癌症类型中显示出强大的预后价值，并与免疫检查点表达、肿瘤免疫功能障碍和对免疫治疗的反应显著相关。CRISPR/Cas9依赖性筛选突出了模型基因中的治疗脆弱性。

结论

我们发现内皮细胞在TME中作为血栓形成相关转录的中央调节器，并揭示了一个连接VTE、免疫逃逸和肿瘤进展的新轴。Endo.VTM为预后分层提供了一个临床可行的框架。