《JACC: Clinical Electrophysiology》:Population-Based Analysis of Rare Genetic Variants in Sudden Cardiac Arrest
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埃文·P·克兰斯多夫(Evan P. Kransdorf)|马可·马蒂亚斯(Marco Mathias)|中村幸子(Kotoka Nakamura)|哈普里亚·楚格(Harpriya Chugh)|大卫·阮(David Nguyen)|乔纳森·泰勒(Jonathan Tyrer)
埃文·P·克兰斯多夫(Evan P. Kransdorf)|马可·马蒂亚斯(Marco Mathias)|中村幸子(Kotoka Nakamura)|哈普里亚·楚格(Harpriya Chugh)|大卫·阮(David Nguyen)|乔纳森·泰勒(Jonathan Tyrer)|保罗·D·法罗阿(Paul D. Pharoah)|金达伦·雷尼尔(Kyndaron Reinier)|泽内普·阿克德米尔(Zeynep Akdemir)|埃里克·布尔温克尔(Eric Boerwinkle)|余冰(Bing Yu)|苏米特·S·楚格(Sumeet S. Chugh)
美国加利福尼亚州洛杉矶西达-赛奈医疗中心(Cedars-Sinai Medical Center)斯米特心脏研究所(Smidt Heart Institute)心脏骤停预防中心(Center for Cardiac Arrest Prevention)
摘要
背景
每年有超过36万美国人经历心脏骤停(SCA)。其中一部分病例由罕见的基因变异引起,但现有的研究并非基于人群样本,且仅限于非幸存者。
目的
本研究旨在确定普通人群中SCA幸存者和非幸存者中致病性罕见基因变异的流行情况。
方法
研究从俄勒冈州和加利福尼亚州的两项社区研究中招募了3,264名SCA患者,并将其与ARIC(Atherosclerosis Risk in Communities)研究中的13,258名对照组参与者进行了比较。对与心律失常/心肌病相关的63个候选基因进行了全基因组测序。根据美国医学遗传学和基因组学学院的最新标准,识别出可能致病的基因变异。同时进行了基因聚集病例对照分析,并将变异比例与基因组聚合数据库进行了比较。
结果
在SCA组中,130名患者(4.0%)携带致病性基因变异,而ARIC组中这一比例为323名患者(2.4%)(OR:1.59;P < 0.001)。在非缺血性SCA患者亚组中,638名患者中有39名(6.1%)携带致病性基因变异(OR:2.52;P < 0.001)。我们发现了15个与SCA风险增加相关的基因:ACTC1、BAG3、CACNA1C、DES、DSG2、DSP、FLNC、KCNH2、KCNQ1、LMNA、MYBPC3、MYH7、PKP2、RBM20和TTN。
结论
在15个与心律失常和心肌病相关的基因中发现的特定致病性基因变异与社区中SCA风险增加有关。这些发现将有助于针对携带这些基因变异的家庭成员制定针对性的SCA预防策略。
章节摘录
SCA样本与对照组
本研究在西达-赛奈医疗中心、俄勒冈健康与科学大学以及文图拉县医疗中心的机构审查委员会批准的计划下进行。SCA患者来自俄勒冈州穆尔特诺玛县(SUDS,n = 2,512)11,12和加利福尼亚州文图拉县(PRESTO,n = 966)13(图1)。两项研究的详细确定、评估和表型分析方法相同。11,14,15。如果患者DNA
SCA组与对照组
研究纳入了来自SUDS(n = 2,364,占72%)和PRESTO(n = 900,占28%)的3,264名SCA患者,以及来自ARIC研究的13,258名对照组参与者(图1)。SCA患者和ARIC对照组参与者在流行病学特征上存在显著差异(表1):SCA患者年龄更大(66岁 vs 54岁,P < 0.001),女性比例更低(30% vs 56%,P < 0.001),自报为白人的比例更高(88% vs 76%,P < 0.001)。基因祖先背景高度匹配
讨论
在这项针对63个与孟德尔遗传性心律失常和心肌病相关基因的社区研究中,我们发现4.0%的SCA患者携带致病性基因变异,显著高于ARIC对照组中的2.4%。在非缺血性SCA患者中,这一比例更高,为6.1%。我们确定了13个基因,这些基因与整个SCA组或其亚组中的SCA风险显著增加有关。
结论
在这项针对SCA患者的社区研究中,我们发现了15个与SCA风险增加相关的基因。将这些基因纳入SCA的基因检测中,将有助于更准确地识别高风险人群。
资金支持与作者披露
本研究部分由美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)的国家心肺血液研究所(National Heart, Lung, and Blood Institute)资助,资助编号为R01HL145675和R01HL147358,资助对象为楚格博士(Dr Chugh)。楚格博士担任西达-赛奈医疗中心的心脏电生理学教授(Pauline and Harold Price Chair)。Atherosclerosis Risk in Communities研究完全或部分由美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)下属的国家心肺血液研究所(National Heart, Lung, and Blood Institute)提供联邦资金支持,合同编号为
致谢
作者感谢Atherosclerosis Risk in Communities研究的所有工作人员和参与者的宝贵贡献。