D-亮氨酸修饰的 Sansalvamide A 类似物:光诱导合成、靶点预测及抗肿瘤潜力研究

《RSC Advances》:D-Leucine modified Sansalvamide A analogs: photo-induced synthesis, target prediction, and antitumor potential study

【字体: 时间:2026年05月23日 来源:RSC Advances 4.6

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  环肽在癌症治疗中展现出希望,但受到天然产量低和代谢稳定性差的阻碍。本研究通过亮氨酸(Leu)构型修饰和绿色分子内光诱导单电子转移(SET)环化反应,合成了 Sansalvamide A 类似物(化合物 1–5),该方法将具有抗肿瘤活性的异吲哚啉酮引入骨架以增强

  
环肽在癌症治疗中展现出希望,但受到天然产量低和代谢稳定性差的阻碍。本研究通过亮氨酸(Leu)构型修饰和绿色分子内光诱导单电子转移(SET)环化反应,合成了 Sansalvamide A 类似物(化合物 1–5),该方法将具有抗肿瘤活性的异吲哚啉酮引入骨架以增强结构刚性。体外 MTT 法测定显示,环肽表现出一定程度的肿瘤细胞抑制活性,其中化合物 5(具有多个 D-亮氨酸修饰)表现出相对较强的活性。靶点预测和蛋白 - 蛋白相互作用(PPI)分析鉴定出 BCL2 为关键枢纽靶点,这一发现经分子对接进一步证实,结果显示化合物 5 通过稳定的氢键和疏水相互作用(包括烷基、π-阳离子和π-σ相互作用)与 BCL2 表现出高结合亲和力。同时,JC-1 实验证实化合物 5 能有效降低线粒体膜电位(MMP),从而赋予其诱导肿瘤细胞凋亡的潜力。计算机辅助的吸附、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)预测进一步支持了化合物 5 的实际应用潜力。该研究为基于肽的药物 - 靶点设计提供了有益指导。
**研究背景与意义**
近年来,多肽药物在疾病治疗和健康领域发展迅速。其中,环肽化合物因其构象稳定,在癌症治疗中具有重要潜力。然而,天然环肽存在产量低的问题,且其结构修饰以改善理化性质的研究正受到越来越多的关注。目前的挑战在于,传统的环化方法限制了环肽的高效合成与结构修饰,且肿瘤微环境中丰富的肽酶和蛋白酶能迅速水解含天然 L-氨基酸残基的环肽,导致其体内失活。相比之下,D-氨基酸不仅能逃避水解,还可能优化环肽与肿瘤靶点疏水活性口袋的结合。此外,Yoon 等人开发的分子内光诱导单电子转移(SET)环化反应,利用邻苯二甲酰亚胺作为电子受体,末端含三甲基硅基(TMS)的肽链作为电子供体,在光激发下快速构建“供体 - 受体”系统,不仅能实现绿色快速环化,还能引入具有抗肿瘤活性的异吲哚啉酮结构,显著增强结构刚性。基于此,研究人员旨在通过改变亮氨酸(Leu)残基的构型,设计并合成一系列 Sansalvamide A(San A)类似物,评估其抗肿瘤活性,预测潜在靶点,并通过分子对接和计算机辅助 ADMET 分析深入探讨其作用机制及成药性。该研究成果发表于《RSC Advances》。

**主要研究方法**
研究人员首先通过化学合成法制备了具有分子内电子“供体 - 受体”系统的线性前体肽(化合物 1a–5a),利用 EEDQ 活化羧基并引入含 TMS 的构建模块,最后在 N 端引入邻苯二甲酰甘氨酸作为电子受体。随后,在自建光反应器中,以 450 W 中压汞灯为光源(300–400 nm),在氮气保护下的甲醇溶液中进行光诱导 SET 环化反应,合成目标环肽(化合物 1–5)。研究采用 MTT 法评估了化合物对肝癌(HepG-2)、乳腺癌(4T1)、结肠癌(CT26)细胞及正常成纤维细胞(L929,源自哈尔滨医科大学)的抑制活性。利用 SWISS 数据库预测靶点,结合 GeneCards 癌症基因库筛选重叠靶点,通过 STRING 数据库和 Cytoscape 软件构建蛋白 - 蛋白相互作用(PPI)网络。进一步利用 DAVID 数据库进行基因本体(GO)和 KEGG 通路富集分析。通过分子对接技术计算化合物与关键靶点的结合能及相互作用模式。最后,利用 JC-1 探针检测线粒体膜电位变化,并通过 ADMETlab 3.0 平台进行计算机辅助药代动力学及毒性预测。

**研究结果**
**2.1 合成**
研究人员成功合成了目标线性肽(1a–5a)和环肽(1–5)。通过核磁共振(1H NMR、13C NMR)和质谱对产物进行了表征。结果表明,光诱导 SET 反应能高效地将异吲哚啉酮结构引入环肽骨架,实现了 San A 类似物的绿色合成。

**2.2 体外抗肿瘤活性**
MTT assay 结果显示,与线性肽相比,环肽对三种肿瘤细胞系表现出显著的增殖抑制作用,且对正常 L929 细胞无明显毒性。其中,含多个 D-亮氨酸修饰的化合物 5 活性最强。这表明改变 Leu 残基构型可通过调节整体空间构象和优化侧链疏水取向双重途径,提高化合物与靶蛋白的结合效率和特异性。

**2.3 PPI 网络分析**
通过 PPI 网络分析,研究人员从 60 个癌症相关重叠靶点中识别出 6 个核心枢纽靶点:BCL2、MMP9、CTSB、CTSS、BCL2L1 和 MMP2。其中 BCL2 的 Degree 值最高,提示其为关键作用靶点。

**2.4 GO 和 KEGG 通路富集分析**
GO 分析表明,预测靶点主要富集于细胞凋亡过程、BAD-BCL-2 复合物形成等通路;KEGG 分析显示相关基因富集于凋亡、Notch 信号通路、癌症通路、p53 信号通路等。这提示化合物 1–5 可能通过调控这些通路发挥抗肿瘤作用。

**2.5 分子对接分析**
分子对接结果显示,环肽与 BCL2 的结合能力优于线性肽。化合物 5 与 BCL2 的对接得分为?10.8 kcal mol?1,表明结合力极强。相互作用分析表明,化合物 5 通过常规氢键(与 Ser26、Arg297 残基)以及多种疏水相互作用(包括烷基、π-阳离子和π-σ相互作用,涉及 Arg、Trp、Met、Pro、Tyr 等残基)稳定地结合在 BCL2 的疏水口袋中。

**2.6 JC-1 检测 MMP 变化**
JC-1 实验显示,经化合物 5 处理后,4T1 细胞内的红色荧光(高 MMP)显著减弱,绿色荧光(低 MMP)增强,且呈浓度依赖性。这证实化合物 5 能通过靶向 BCL2 破坏线粒体膜电位,进而诱导肿瘤细胞凋亡。

**2.7 计算机辅助 ADMET 研究**
ADMET 预测表明,尽管化合物 5 分子量较大且违反 Lipinski 五规则,口服吸收可能受限,但其脂溶性(log P)和水溶性(log S)适宜,符合 Pfizer 成药性标准。该化合物血脑屏障透过率低,中枢神经副作用风险小。代谢方面,它是 CYP2C19 的底物并抑制 CYP3A4,具有联合用药潜力。其半衰期适中(1.208 h),且致癌性、血液毒性和肝毒性风险极低,具备良好的安全性基础。

**结论与讨论**
综上所述,本研究成功利用 D-亮氨酸构型修饰结合绿色光诱导 SET 环化策略,合成了一系列 Sansalvamide A 类似物。其中,化合物 5 展现出优异的体外抗肿瘤活性和低毒性。通过网络药理学分析确定 BCL2 为其关键靶点,分子对接和 JC-1 实验进一步证实化合物 5 能通过多重相互作用高亲和力结合 BCL2,降低线粒体膜电位,从而诱导肿瘤细胞凋亡。计算机辅助 ADMET 预测也支持其良好的成药性和安全性。该研究不仅设计合成了一种有前景的抗癌候选药物,也为基于环肽的药物设计提供了重要的理论依据和实践指导。
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