波兰山羊群中Haemonchus contortus种群中E198A和F200Y单核苷酸多态性的流行情况

《Scientific Reports》：The prevalence of E198A and F200Y single nucleotide polymorphism in Haemonchus contortus populations from Polish goat herds

　　

摘要

本研究对81个山羊群进行了横断面描述性分析，旨在调查与波兰山羊体内Haemonchus contortus对苯并咪唑（BZ）抗性相关的两种单核苷酸多态性（SNPs：E198A和F200Y）的流行率和频率。通过幼虫培养确定了每个山羊群粪便样本中胃肠道线虫（GIN）属/种的分布，并使用实时PCR技术确认了H. contortus DNA的存在。通过焦磷酸测序技术检测到这些SNPs并量化了其频率。根据含有每种SNP的等位基因频率，应用哈迪-温伯格原理（Hardy–Weinberg principle）估算了H. contortus基因型的频率。在每个山羊群内的H. contortus种群中均检测到至少一种与BZ抗性相关的SNP：79/81个山羊群中的F200Y SNP（98%），80/81个山羊群中的E198A SNP（99%）。F200Y和E198A在各个山羊群中的中位频率分别为86%和8%。在整个波兰H. contortus种群中，BZ抗性基因型的总体频率估计为89%（95%置信区间：82%–93%），并且与以下因素呈正相关且具有独立性：从国外购买山羊（调整后的比值比[OR_adj] 22.8 [95%置信区间：8.9–58.4]；p<0.001）、山羊群规模较大（>100只山羊；OR_adj 7.5 [95%置信区间：1.8–30.5]；p=0.006）、使用左旋咪唑进行山羊驱虫（OR_adj 3.1 [95%置信区间：1.2–7.8]；p=0.019）以及每年进行多次抗寄生虫治疗（OR_adj 3.1 [95%置信区间：1.0–9.5]；p=0.046）。研究表明，波兰山羊体内的H. contortus对BZ具有广泛的遗传抗性。因此，强烈建议重新考虑常规使用BZ的做法，并实施综合和可持续的寄生虫控制策略。