一种新型可转座元件的识别与沉默机制

《Nature Communications》：Recognition and silencing of a new transposable element

　　

摘要

基因组不断面临转座元件（TEs）和其他基因组寄生体的威胁。虽然现有转座元件的沉默机制已被广泛研究，但对于细胞如何识别之前未曾遇到的新入侵转座元件，我们知之甚少。为此，我们将外源序列插入到 S. pombe 中进行探究。研究结果表明，新入侵的转座元件 tj1 被 RNAi 和异染色质识别并作为沉默目标。识别的效率以及沉默的程度和稳定性取决于转座元件的拷贝数和插入位置。我们发现，宿主识别的是 RNA 而非 DNA，并且转座元件的识别效率与其上游转录本产生的反义 RNA 水平相关。此外，我们还发现一些非转座性质的基因也能引发沉默反应。研究数据表明，沉默过程可能并不需要宿主防御系统专门识别转座元件中的特定序列，而是宿主转录模式的改变会触发对转座元件的识别。