通过整合单细胞蛋白质组学技术，在成年小鼠心肌细胞的一个亚群中发现了具有再生特性的指纹特征

《Genome Biology》：Pro-regenerative fingerprints identified in a sub-population of adult mouse cardiomyocytes by integrative single-cell proteomics

摘要

背景

近期在仪器灵敏度和样品制备技术方面的进步显著提高了通过基于质谱的蛋白质组学方法研究单细胞水平细胞群体异质性的能力。整合多层细胞数据为单细胞蛋白质组学提供了额外的、尚未探索的见解。在再生研究中，已有研究表明由Myc转录因子过表达驱动的心肌细胞增殖现象，但这一过程尚未在单细胞分辨率下得到研究。

结果

通过使用从小鼠模型中优化的成年心肌细胞分离程序，并利用iSanXoT应用程序的集成功能，我们能够最小化批次效应和与细胞大小相关的偏差，获得定量性的亚细胞区室信息，并检测亚细胞区室内的蛋白质变化（这在之前的方法中尚未实现）。这种方法提高了数据量化的准确性，便于生物学解释。我们发现Myc转录因子改变了代谢酶的表达谱，并激活了一类具有促再生特征的成年心肌细胞亚群。

结论

我们证明了不同层次的信息可以正确地描绘单细胞的蛋白质组学特征。利用iSanXoT的集成统计框架分析单个心肌细胞数据，为理解Myc转录因子在成年小鼠心肌细胞中引发的不同不成熟状态和促再生特征提供了重要线索。小鼠心肌细胞在Myc过表达情况下表现出的细胞异质性表明，在单细胞水平上进行再生研究对于精确确定心脏中这种反应的幅度具有重要意义。