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滴式数字PCR在胰腺癌细胞学标本中用于KRAS突变分析的诊断性能
《Journal of Gastroenterology》:Diagnostic performance of droplet digital PCR for KRAS mutation analysis in pancreatic cancer cytology specimens
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年05月25日 来源:Journal of Gastroenterology 5.5
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摘要背景识别KRAS突变对于胰腺癌的管理日益重要,尤其是在新型KRAS抑制剂开发的情况下。然而,获取足够的组织样本进行基因组分析往往具有挑战性。本研究评估了使用内镜超声引导下细针穿刺(EUS-FNA)获得的剩余细胞学洗涤液进行快速KRAS突变分析的临床实用性。方法我们分析了38名
识别KRAS突变对于胰腺癌的管理日益重要,尤其是在新型KRAS抑制剂开发的情况下。然而,获取足够的组织样本进行基因组分析往往具有挑战性。本研究评估了使用内镜超声引导下细针穿刺(EUS-FNA)获得的剩余细胞学洗涤液进行快速KRAS突变分析的临床实用性。
我们分析了38名胰腺癌患者。通过ddPCR(阈值0.1%)检测了肿瘤组织和细胞学标本中的KRAS突变,并将其与组织标本的下一代测序(NGS,阈值1.0%)结果进行了比较。此外,还评估了组织标本和细胞学标本之间ddPCR结果的一致性。
ddPCR的分析完成率为100%。在总体识别KRAS突变(存在或不存在)方面,组织NGS与细胞学ddPCR之间以及组织ddPCR与细胞学ddPCR之间均达到了完全一致(100%,38/38例)。在组织NGS与细胞学ddPCR比较中,最高等位基因频率(VAF)变异体的符合率为92%(35/38例),而在组织VAF>5%的病例中,这一符合率达到了100%。同样,在使用ddPCR进行组织与细胞学标本之间的交叉比较时,最高VAF变异体的符合率也为92%(35/38例),而在VAF>5%的标本中,符合率为100%(32/32例)。这些结果表明两种平台和不同类型的标本之间具有高度一致性。
对细胞学标本进行ddPCR分析是评估KRAS突变的一种非常可行的方法。其高灵敏度使得可以利用剩余的诊断材料进行分子分析,从而在胰腺癌管理中快速做出临床决策,而无需额外收集组织样本。
识别KRAS突变对于胰腺癌的管理日益重要,尤其是在新型KRAS抑制剂开发的情况下。然而,获取足够的组织样本进行基因组分析往往具有挑战性。本研究评估了使用内镜超声引导下细针穿刺(EUS-FNA)获得的剩余细胞学洗涤液进行快速KRAS突变分析的临床实用性。
我们分析了38名胰腺癌患者。通过ddPCR(阈值0.1%)检测了肿瘤组织和细胞学标本中的KRAS突变,并将其与组织标本的下一代测序(NGS,阈值1.0%)结果进行了比较。此外,还评估了组织标本和细胞学标本之间ddPCR结果的一致性。
ddPCR的分析完成率为100%。在总体识别KRAS突变(存在或不存在)方面,组织NGS与细胞学ddPCR之间以及组织ddPCR与细胞学ddPCR之间均达到了完全一致(100%,38/38例)。在组织NGS与细胞学ddPCR比较中,最高等位基因频率(VAF)变异体的符合率为92%(35/38例),而在组织VAF>5%的病例中,这一符合率达到了100%。同样,在使用ddPCR进行组织与细胞学标本之间的交叉比较时,最高VAF变异体的符合率为92%(35/38例),而在VAF>5%的标本中,符合率为100%(32/32例)。这些结果表明两种平台和不同类型的标本之间具有高度一致性。
对细胞学标本进行ddPCR分析是评估KRAS突变的一种非常可行的方法。其高灵敏度使得可以利用剩余的诊断材料进行分子分析,从而在胰腺癌管理中快速做出临床决策,而无需额外收集组织样本。