mRNA测序结果显示，在不同产油品种的Ocimum sanctum L中，萜烯合成酶和丁子香酚合成酶基因的转录存在差异

《Scientific Reports》：mRNA sequencing revealed transcriptional variability of terpene and eugenol synthase genes among distinct oil yielding accessions of Ocimum sanctum L

摘要

Ocimum sanctum是一种重要的药用植物，但目前缺乏足够的分子生物学研究资源。本研究通过全mRNA测序来开发相关分子资源，重点探讨了该植物高油产和低油产品种中萜类化合物的生物合成过程及其相关基因的表达情况。测序结果显示，OS1和OS38样本分别获得了3.3391亿和3.731亿条高质量转录本数据。在OS1中，31,820个转录本中有30,217个被成功注释；在OS38中，32,564个转录本中有30,546个被注释。KEGG通路分析在OS1中识别出25,643个相关转录本，在OS38中识别出26,382个。GO和KEGG注释有助于鉴定特定性状相关的基因，其中包括参与萜类化合物生物合成的基因。GC–MS分析进一步证实了精油中确实含有33种萜类化合物。此外，通过RT-PCR技术对参与萜类化合物和丁子香酚生物合成的6个基因进行了相对表达分析，以验证这些基因的实际表达情况。结果显示，OS1中的Germacrene A合成酶和OS38中的3-S Linalool合成酶的表达水平高于其他基因。这些研究结果为萜类化合物生物合成的转录本多样性提供了科学依据，并为未来对O. sanctum的遗传改良提供了基础。