
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
对虎耳草(Houttuynia cordata)不同部位中黄酮类化合物的整合代谢组学和转录组学分析
《BMC Genomics》:Integrated metabolomics and transcriptomics analysis of flavonoids in different parts of Houttuynia cordata
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年05月27日 来源:BMC Genomics 3.7
编辑推荐:
摘要背景Houttuynia cordata(H. cordata)是一种具有重要药用和食用价值的植物。然而,其黄酮类化合物的代谢特征和生物合成途径仍不甚明了。因此,本研究采用了代谢组学和转录组学方法来分析H. cordata的根、茎和叶,以期阐明这一问题。结果共鉴定出471种代
Houttuynia cordata(H. cordata)是一种具有重要药用和食用价值的植物。然而,其黄酮类化合物的代谢特征和生物合成途径仍不甚明了。因此,本研究采用了代谢组学和转录组学方法来分析H. cordata的根、茎和叶,以期阐明这一问题。
共鉴定出471种代谢物,其中黄酮类化合物占主导地位。关键黄酮类化合物(如槲皮素、山柰酚和芸香苷)在叶片中的相对含量最高,这一结果通过靶向绝对定量分析得到了进一步验证。转录组学分析显示不同组织之间存在大量差异表达基因(DEGs)。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析表明,苯丙素类和黄酮类化合物的生物合成途径在差异表达基因中显著富集。这些途径中的大多数差异表达基因(如编码PAL、4CL、CHS和CHI的基因)在叶片中表达上调。这些基因通过实时定量PCR(RT-qPCR)进一步得到验证,其结果与转录组学数据一致。
本研究全面概述了H. cordata不同部位的代谢物分布和基因表达情况。我们的发现表明叶片是H. cordata中黄酮类化合物积累和生物合成的主要场所,为候选基因的利用及未来这些途径的功能研究奠定了基础。
Houttuynia cordata(H. cordata)是一种具有重要药用和食用价值的植物。然而,其黄酮类化合物的代谢特征和生物合成途径仍不甚明了。因此,本研究采用了代谢组学和转录组学方法来分析H. cordata的根、茎和叶,以期阐明这一问题。
共鉴定出471种代谢物,其中黄酮类化合物占主导地位。关键黄酮类化合物(如槲皮素、山柰酚和芸香苷)在叶片中的相对含量最高,这一结果通过靶向绝对定量分析得到了进一步验证。转录组学分析显示不同组织之间存在大量差异表达基因(DEGs)。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析表明,苯丙素类和黄酮类化合物的生物合成途径在差异表达基因中显著富集。这些途径中的大多数差异表达基因(如编码PAL、4CL、CHS和CHI的基因)在叶片中表达上调。这些基因通过实时定量PCR(RT-qPCR)进一步得到验证,其结果与转录组学数据一致。
本研究全面概述了H. cordata不同部位的代谢物分布和基因表达情况。我们的发现表明叶片是H. cordata中黄酮类化合物积累和生物合成的主要场所,为候选基因的利用及未来这些途径的功能研究奠定了基础。