一种基于DNA甲基化的算法在前列腺癌、肺癌、结直肠癌和卵巢癌筛查试验中提高了肺癌风险预测的准确性

《Lung Cancer》：A DNA Methylation-based algorithm Improves Lung Cancer risk prediction in the Prostate, Lung, Colorectal and Ovarian Cancer Screening Trial

亮点

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一种仅包含cg05575921甲基化和吸烟包年数据的算法，其性能显著优于PLCOm2012算法。

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该算法可以通过识别吸烟包年数小于20年但患癌症风险较高的人群，提高LDCT筛查的效率。

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需要在LDCT筛查人群中进一步测试该算法。

图形摘要

摘要

引言

测量cg05575921的DNA甲基化水平可以提高对符合筛查条件的人群中肺癌（LC）风险的预测。然而，这些发现基于的样本量有限，且主要来自白人参与者，这些参与者有长期吸烟（>30包年）的历史，而且基于cg05575921的指标并未与现有的肺癌预测标准进行直接比较。

方法

我们在一个包含1156例肺癌病例和3039例对照组的嵌套病例对照队列中确定了cg05575921的甲基化水平，这些对照组在年龄、性别、种族和自我报告的吸烟状况（当前和过去）方面进行了匹配，他们参与了前列腺、肺、结直肠和卵巢（PLCO）癌症筛查试验。然后，我们构建了生存算法，以测试将cg05575921的甲基化水平添加到由PLCOm2012算法组成的模型中是否能够提高肺癌诊断时间的预测能力。

结果

将cg05575921的甲基化水平添加到PLCOm2012模型中后，对于报告当前或过去吸烟的受试者，在20年的随访期内，肺癌发生的预测能力显著提高。在这组在年龄、性别和吸烟状况方面匹配的受试者中，使用cg05575921和吸烟包年数的简单算法在所有吸烟者（20年曲线下面积[AUC]为0.725 vs 0.689）、≥20年吸烟史的受试者（20年AUC为0.662 vs 0.634）以及<20年吸烟史的受试者（20年AUC为0.666 vs 0.549）中都优于PLCOm2012算法。在吸烟包年数<20年的参与者中，cg05575921甲基化水平<80%的受试者患肺癌的风险是那些具有相似吸烟包年史但cg05575921甲基化水平>80%的受试者的3.3倍。

结论

使用cg05575921的甲基化水平可以提高肺癌风险预测的准确性，特别是在识别吸烟包年数<20年但肺癌风险较高的人群方面可能特别有用。这些发现需要在外部筛查人群中进行验证。