在分化早期，凝聚素（cohesin）介导的环状结构挤压（loop extrusion）在增强子激活的基因表达过程中起着重要作用

《Nature Communications》：Loop extrusion by cohesin plays a role in enhancer-activated gene expression early in differentiation

摘要

增强子及其目标启动子在激活时常会紧密相邻。这可以通过多种机制来解释，包括由凝聚素介导的染色质环挤压。然而，凝聚素的急性缺失并不会导致基因表达的广泛变化。我们研究了在红细胞生成过程中，凝聚素介导的染色质环挤压对小鼠α-珠蛋白基因表达的影响。凝聚素的急性缺失会干扰α-珠蛋白在分化早期阶段的表达，但不会影响后期阶段。此外，当在α-珠蛋白增强子和启动子之间插入一个或多个已知能够阻断凝聚素的CTCF位点时，α-基因的表达也会受到干扰。重要的是，CTCF位点的位置至关重要，这表明在成熟的红细胞中，凝聚素主要（但并非唯一）从增强子转移到启动子。我们发现，染色质环挤压在建立增强子与启动子之间的邻近关系以及随后可诱导基因的表达过程中确实起着重要作用。