中国耐药结核分枝杆菌的长期时空演变

《Nature Communications》：Long-term spatiotemporal evolution of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis in China

　　

摘要

抗生素已被用于治疗结核病超过80年，然而在抗生素压力下结核分枝杆菌（Mtb）的长期进化动态在群体水平上仍知之甚少。在这里，我们分析了超过18,000个可用的Mtb基因组，以重建中国范围内耐药性的时间和空间演变过程。我们观察到，对不同药物的耐药性突变反复出现，形成了数百到上千个小的耐药性分支，这些分支主要在过去的二十年里出现。一旦形成，这些分支的传播主要局限于省内，但随着人类流动性的增加和细菌适应性的提高，它们也可能在地理上扩散。此外，我们整合了已发表的基因组数据和CRISPRi筛选数据，以识别与耐药性出现和传播相关的突变。我们的研究强调了人类迁移和细菌适应在塑造中国地方性耐药结核病流行中的重要作用。