《Journal of Integrative Agriculture》:Multi-level transcriptomics reveals FecB-associated and non-FecB ovarian regulatory programs underlying sheep prolificacy
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郝莉 | 何宇辰 | 杜小龙 | 张世文 | 倪思佳 | 张晓旭 | 庄子阳 | 孟竹 | 吴凌云 | 刘飞 | 孙向荣 | 胡阳硕 | 彭佛 | 潘章远中国农业科学院动物科学研究所动物生物技术育种国家重点实验室,北京 100193,中国摘要繁殖性能是影响绵羊生产效率和可持续性的
郝莉 | 何宇辰 | 杜小龙 | 张世文 | 倪思佳 | 张晓旭 | 庄子阳 | 孟竹 | 吴凌云 | 刘飞 | 孙向荣 | 胡阳硕 | 彭佛 | 潘章远
中国农业科学院动物科学研究所动物生物技术育种国家重点实验室,北京 100193,中国
摘要
繁殖性能是影响绵羊生产效率和可持续性的关键因素,但其分子机制尚未完全阐明。本研究通过结合多组织转录组学、差异表达分析、跨物种比较转录组学和单细胞转录组学,构建了一个关于绵羊卵巢生物学的综合框架。首先,我们分析了不同组织中的卵巢特异性基因表达,鉴定出3,483个卵巢特异性基因,其中包含FOXL2和BMPR1B等关键调控因子。接着,我们比较了具有不同FecB基因型的高产和低产绵羊群体。在比较BB型高产绵羊与++型低产绵羊时,参与排卵周期的基因(包括BMPR1B、IGF1R和GDF9)显著富集,表明这些基因与卵泡调控轴密切相关。而在比较++型高产绵羊与++型低产绵羊时,BMP信号通路(包括ACVR2B、BMPR1A和BMP4)显著富集,这提示缺乏FecB突变的绵羊的高产性可能由不同的分子机制调控。跨物种分析进一步发现了保守的生殖相关基因(如LHX9和WNT4),支持卵巢调控机制的进化保守性。在单细胞水平上,BMPR1B在卵泡颗粒细胞中也有显著表达。综合分析结果表明,IGF1R可能是与FecB基因型相关的关键调控因子,而HGF可能是非FecB型绵羊高产性的调控因子。