高级别浆液性卵巢癌的单细胞空间图谱揭示MHC II类分子是预测肿瘤空间生态系统和临床结局的关键因素 现已可供购买

《Cancer Discovery》：Single-Cell Spatial Atlas of High-Grade Serous Ovarian Cancer Uncovers MHC Class II as a Key Predictor of Spatial Tumor Ecosystems and Clinical Outcomes Available to Purchase

摘要

高级别浆液性卵巢癌（HGSC）的肿瘤微环境是一个由恶性细胞与宿主细胞相互作用构成的复杂网络，但其调控机制仍不明确。我们基于280名患者的转移性HGSC样本，构建了一个单细胞空间图谱，整合了高维成像技术和分子分析结果。通过对929个单细胞图谱的分析，我们发现了具有不同细胞组成的空间区域，并发现肿瘤-基质界面处的免疫细胞共浸润会影响临床预后。利用随机森林算法（CEFIIRA）对细胞特征重要性进行评估，发现肿瘤细胞MHC II类（MHCII）的表达是预测患者长期生存的关键因素。通过解卷积单细胞数据和两个独立的空间转录组数据集的验证，以及免疫肽组学分析，证实MHCII表达与免疫激活、抗原呈递和T细胞受体克隆性相关。利用患者来源的免疫肿瘤学平台，我们发现PD-1阻断后肿瘤MHCII表达可增强CD8⁺ T细胞的细胞毒性，而阻断MHCII则会抑制这种激活作用。我们的图谱为免疫激活机制提供了新的见解，有助于优化HGSC患者的分层治疗。

意义：

本研究首次构建了大规模的HGSC单细胞空间图谱，揭示了肿瘤-免疫系统的相互作用如何影响疾病结局。我们发现肿瘤内在的MHCII表达是局部免疫激活和免疫治疗反应性的关键驱动因素，这一发现为卵巢癌患者的精准分层和治疗决策提供了重要的生物标志物。

参见Conejo-Garcia和Dangaj Laniti的相关评论，第1041页

数据可用性

关于多组学数据，包含单细胞空间t-CycIF数据及其群体级注释（包括分子谱型、治疗方案和临床生存数据），已存储在synapse.org：https://doi.org/10.7303/SYN72380119。如需用于非商业或学术目的，可向通讯作者提出合理请求以获取荧光显微镜图像，所有请求将在15个工作日内得到及时处理。来自荷兰癌症登记处（NKR）的匿名个体级临床数据将在非商业、研究或统计分析的前提下按个案审批（需通过[e-mail]联系申请）。由于患者隐私保护要求，本研究生成的人类序列数据不对外公开，但可应通讯作者的合理请求提供。芬兰生物库的数据可通过Ingenious平台获取（https://site.fingenious.fi/en/）。用于生成结果的自定义脚本可在https://github.com/farkkilab/devNKI-scripts.git获取。