摘要
尽管免疫疗法已在小细胞肺癌(SCLC)中得到临床应用,但能够预测临床疗效的可靠生物标志物仍然有限。虽然已有研究表明HERV-K(HML-2)亚家族可以调节多种恶性肿瘤的肿瘤免疫反应,其在SCLC中的功能作用仍不明确,尤其是其与炎症微环境及良好免疫疗法结果之间的关联。
通过TELESCOPE技术在IMpower133(n = 271)和PKUPH队列(n = 40)中识别了HERV-K的基因表达谱。使用组织微阵列(n = 48)进行了IHC和RNA荧光原位杂交来验证HERV-K转录本的表达情况。通过单细胞RNA测序和多重IHC(包括PhenoCycler-Fusion)技术来表征肿瘤免疫微环境。
虽然HERV-K亚家族整体上对SCLC的免疫疗法预后没有预测价值,但一个特定位点的HERV-K转录本ERVK18与更好的治疗结果相关,并且与多种免疫激活通路及增加的免疫细胞浸润表现出最强的正相关。单细胞和空间分析进一步显示,高ERVK18表达表明T细胞中的细胞毒性增强,同时肿瘤与T细胞之间的空间邻近性增加。在IMpower133队列中,高ERVK18表达不仅与阿特珠单抗+化疗组的更好预后相关,还预测了接受阿特珠单抗+化疗的患者比单独化疗的患者有更长的总生存期,从而证实ERVK18是SCLC一线PD-L1抑制剂反应的双重预后和预测生物标志物。
ERVK18的高表达代表了炎症微环境,表明SCLC患者的免疫化疗预后较好。
数据可用性
PKUerv_TMA队列的临床信息可向相应作者索取。本研究中生成的scRNA-seq数据可在国家基因组数据中心(NGDC)通过访问号HRA013418获取。IMpower133试验及本研究中分析的另外两个免疫疗法队列的原始RNA-seq数据可在欧洲基因组-表型档案库(European Genome–Phenome Archive)中通过访问码EGAD50000000312获取,也可通过基因表达组学数据库(Gene Expression Omnibus,RRID:SCR_005012)中的访问码GSE135222和GSE126044获取。PKUPH队列的原始测序数据已存入NGDC,项目编号为PRJCA036186。






