周旭明团队刻画哺乳动物 RNA?M6A 修饰特征及其与生活史演化关联

　　

RNA修饰是表观转录组调控的重要组成部分，其中m⁶A（N6-甲基腺苷）是真核生物mRNA中最丰富的化学修饰之一，参与调控RNA稳定性、可变剪接、翻译效率等多个生物学过程。然而，已有研究主要集中于人、小鼠等模式物种，非模式哺乳动物中m⁶A修饰的跨物种分布与演化规律仍缺乏系统认识。

2026年5月，中国科学院动物研究所周旭明研究员团队对覆盖11个目的21种非模式动物肝脏、肾脏和脑等组织m⁶A修饰图谱进行研究和比较分析。研究发现，m⁶A修饰在哺乳动物中呈现中等程度的演化保守性，约25%–36%的直系同源转录本携带保守m⁶A修饰，且修饰位点相比邻近非修饰区域受到更强的纯化选择约束。与此同时，不同物种和组织在修饰水平与分布模式上呈现出丰富的调控多样性。此外，研究发现m⁶A整体修饰水平与可变剪接复杂性显著负相关，细胞实验进一步支持了这一关联；m⁶A修饰位点也更倾向于分布在RNA二级结构的环区而非茎区。

该研究还进一步将m⁶A修饰水平与寿命、成年体重和基础代谢率等生命史性状进行关联分析。结果发现，分别有250、164 和379个基因的m⁶A修饰水平与寿命、成年体重和基础代谢率显著相关。进一步以最大寿命26年为阈值，将21种哺乳动物划分为长寿类群和短寿类群，并比较不同选择压力下的 m⁶A修饰模式。结果发现，在长寿哺乳动物中，高m⁶A修饰水平的基因更常表现为选择放松，而非选择强化。这表明在长寿物种的演化过程中，m⁶A修饰可能与基因调控灵活性、生命史演化以及衰老相关过程存在进化联系。

相关研究成果以“Single-base resolution atlas reveals moderate conservation and regulatory diversity of m⁶A modifications across mammals”为题在线发表于《Nucleic Acids Research》。中国科学院动物研究所张晓晓、张展和刘伟强为共同第一作者，中国科学院动物研究所周旭明研究员为通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、国家重点研发计划、中国科学院动物研究所自助部署项目以及新发和重大传染病防控国家科技重大专项等项目资助。

文章链接：https://doi.org/10.1093/nar/gkag544

图1: 21种哺乳动物多组织m⁶A修饰图谱构建及整体分析框架

图2: m⁶A修饰基因的演化起源及其调控特征

图3:?长寿哺乳动物中高m⁶A修饰基因更倾向于经历选择放松