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首次报告的假单胞菌属土壤菌株引起的血流感染,在MALDI-TOF质谱仪误鉴定后通过全基因组测序得到了确认

《BMC Microbiology》:First reported Pseudomonas soli bloodstream infection confirmed by whole-genome sequencing after MALDI-TOF misidentification

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年06月03日 来源:BMC Microbiology 4.2

编辑推荐:

  摘要目的确定从血液培养中分离出的一种罕见环境型假单胞菌的物种身份,并评估其抗菌耐药性谱和致病潜力。方法通过MALDI-TOF质谱鉴定、抗菌药物敏感性测试和全基因组测序对PS1菌株进行了表征。物种归属通过平均核苷酸同一性(ANI)分析和核心基因组系统发育分析来确定。利用多个数据库对

摘要

目的

确定从血液培养中分离出的一种罕见环境型假单胞菌的物种身份,并评估其抗菌耐药性谱和致病潜力。

方法

通过MALDI-TOF质谱鉴定、抗菌药物敏感性测试和全基因组测序对PS1菌株进行了表征。物种归属通过平均核苷酸同一性(ANI)分析和核心基因组系统发育分析来确定。利用多个数据库对与毒力和耐药性相关的基因进行了注释。通过生物膜形成、血清杀菌试验、铬偶氮罗S(CAS)铁摄取试验以及Galleria mellonella感染模型进行了表型验证。

结果

MALDI-TOF质谱将PS1误鉴定为Pseudomonas putida,而全基因组测序(WGS)确认其为P. soli,与P. soli ASM49897v2的ANI值为99.0536%。PS1对某些β-内酰胺类和复方新诺明具有耐药性,但总体上对碳青霉烯类、氨基糖苷类和喹诺酮类药物仍敏感。基因组分析发现了与藻酸盐生物合成、铁摄取、分泌系统及表面结构重塑相关的毒力相关模块。表型实验表明,PS1具有很强的生物膜形成能力(OD??? = 0.210 ± 0.042)和铁摄取能力(CAS晕圈直径为8.63 ± 0.38毫米),在正常人血清中具有一定存活能力,并在Galleria mellonella模型中表现出剂量依赖性的致死性。

结论

本研究报道了首例通过全基因组测序确认的由P. soli引起的血流感染病例。PS1携带多个与毒力相关的基因模块,并表现出相应的致病表型。这些发现支持P. soli可能具有机会性致病潜力。

目的

确定从血液培养中分离出的一种罕见环境型假单胞菌的物种身份,并评估其抗菌耐药性谱和致病潜力。

方法

通过MALDI-TOF质谱鉴定、抗菌药物敏感性测试和全基因组测序对PS1菌株进行了表征。物种归属通过平均核苷酸同一性(ANI)分析和核心基因组系统发育分析来确定。利用多个数据库对与毒力和耐药性相关的基因进行了注释。通过生物膜形成、血清杀菌试验、铬偶氮罗S(CAS)铁摄取试验以及Galleria mellonella感染模型进行了表型验证。

结果

MALDI-TOF质谱将PS1误鉴定为Pseudomonas putida,而全基因组测序(WGS)确认其为P. soli,与P. soli ASM49897v2的ANI值为99.0536%。PS1对某些β-内酰胺类和复方新诺明具有耐药性,但总体上对碳青霉烯类、氨基糖苷类和喹诺酮类药物仍敏感。基因组分析发现了与藻酸盐生物合成、铁摄取、分泌系统及表面结构重塑相关的毒力相关模块。表型实验表明,PS1具有很强的生物膜形成能力(OD??? = 0.210 ± 0.042)和铁摄取能力(CAS晕圈直径为8.63 ± 0.38毫米),在正常人血清中具有一定存活能力,并在Galleria mellonella模型中表现出剂量依赖性的致死性。

结论

本研究报道了首例通过全基因组测序确认的由P. soli引起的血流感染病例。PS1携带多个与毒力相关的基因模块,并表现出相应的致病表型。这些发现支持P. soli可能具有机会性致病潜力。

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