与二硫键代谢相关基因相关的lncRNAs的整合分析，用于喉鳞状细胞癌的预后风险评估和肿瘤免疫微环境评估

《Human Cell》：Integrative analysis of lncRNAs associated with disulfidptosis-related genes for prognostic risk evaluation and tumor immune microenvironment assessment in laryngeal squamous cell carcinoma

摘要

二硫化物代谢相关凋亡（Disulfidptosis）是一种新兴的、与代谢过程相关的调控性细胞死亡途径，它通过调节氧化还原平衡来促进肿瘤进展。长链非编码RNA（lncRNAs）在肿瘤预后模型中具有巨大潜力，但基于与二硫化物代谢相关基因相关的lncRNAs的预后模型在喉鳞状细胞癌（LSCC）中仍然较为罕见。本研究利用TCGA-LSCC RNA测序数据集，识别出差异表达的二硫化物代谢相关基因（DRGs）以及与这些DRGs共表达的lncRNAs，并通过皮尔逊相关性分析、LASSO Cox回归和Cox回归分析建立了一个由5个lncRNA组成的预后标志物。该标志物将LSCC患者分为高风险和低风险亚组，这两组患者的生存结局存在显著差异，在所分析的TCGA数据集中具有较好的区分性能。模型中的关键致癌lncRNA DUBR与不良预后相关，并且与二硫化物代谢相关基因TLN1存在功能关联。MeRIP-qPCR进一步证实DUBR具有m6A修饰，而METTL3的敲低减少了DUBR的m6A修饰水平，这表明DUBR的m6A修饰可能受到METTL3的调控。DUBR的沉默抑制了LSCC细胞的增殖、迁移、侵袭以及上皮-间质转化（EMT）过程。此外，转染TLN1过表达质粒部分恢复了DUBR敲低所引起的增殖抑制作用，这支持TLN1在DUBR介导的增殖效应中的潜在功能作用。基于风险状态和DUBR表达水平的计算机模拟药物反应分析显示，患者对entinostat、linsitinib和VE-822的反应存在差异。这一经过内部验证的预后标志物可能有助于对所分析的TCGA数据集中的LSCC患者进行预后风险分层，并有望将DUBR作为进一步生物学研究的候选分子。在这些发现具有普遍适用性之前，还需要在独立的外部队列和专门的二硫化物代谢功能检测中进行进一步验证。