整合单细胞分析技术揭示了与实体瘤免疫抑制相关的两种NK细胞群体 现已可供购买

《Cancer Immunology Research》：Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors Available to Purchase

开放型细胞可视化工具

摘要

自然杀伤（NK）细胞是抗肿瘤免疫的关键效应器，但新兴证据表明，不同类型的NK细胞在癌症中的作用各不相同。尽管NK细胞群体具有丰富的多样性，我们仍不清楚这种异质性如何影响免疫反应及最终的临床结果。通过单细胞RNA测序技术，我们系统地分析了癌症患者体内的NK细胞，发现肿瘤浸润NK细胞在表型和功能上存在二分性特征，这种二分性是由驱动IFNG或TGFB1表达的不同内在信号通路所决定的。这些不同的信号通路与特定的转录因子网络相关，这些网络整合了肿瘤微环境中的信号，使NK细胞倾向于发挥促炎或抑制性功能。研究发现，NK细胞朝任一功能方向发展与其表型特征密切相关。从循环系统中招募的典型NK细胞主要将抑制性TGFB1信号传递给肿瘤内的效应CD8+ T细胞；值得注意的是，这些亚群在所有肿瘤类型中的TGFB1表达水平均高于肿瘤内的髓系细胞。相比之下，一种组织驻留（TR）的适应性NK细胞亚群仅表现出促炎性的IFNG驱动特征，并与原发性和转移性肿瘤患者的较长生存期相关。此外，只有这种TR适应性NK细胞（而非其他亚群）与免疫检查点阻断反应有关。总体而言，我们的研究揭示了NK细胞中一个先前未被认识到的调控轴，该轴不仅决定了NK细胞的多样性，还增强了更广泛的抗肿瘤免疫反应。

数据可用性

本研究未生成新的scRNA-seq数据，而是分析了补充表S1中已公开的现有数据。用于临床关联分析的RNA-seq数据可在Caris Life Sciences的许可下提供，联系方式为A. Elliott（[e-mail]），需提交意向书。相应的原始测序数据归Caris Life Sciences所有，出于专利和隐私保护原因，数据访问受到限制。NK细胞的处理后单细胞分析结果可通过交互式网络工具（https://umnnkatlas.shinyapps.io/shinyapp/）获取，并已与分析代码一起存储在Zenodo平台上（https://doi.org/10.5281/zenodo.17634053）。数据来源：《整合单细胞分析揭示与实体瘤免疫抑制相关的NK细胞二分性群体》（Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors）。

注：部分链接可能无法正常加载，请尝试其他访问方式。