精细定位和转录组分析揭示了BnaMMS这一新基因位点，该位点通过生长素途径调控油菜的多主茎表型

《BMC Plant Biology》：Fine mapping and transcriptomic analysis reveal BnaMMS, a novel locus regulating multi-main-stem phenotype via auxin pathway in rapeseed

　　

摘要

多主茎（MMS）性状在改善油菜（Brassica napus L.）的植株结构及提高产量方面具有巨大潜力。然而，MMS形成的分子机制目前仍不明确。在本研究中，我们鉴定了一种具有显性MMS特性的材料1030R。遗传分析表明，MMS表型由一个名为BnaMMS的显性基因控制。通过结合BSA-seq技术和精细作图，我们将BnaMMS定位到A6染色体上的一个70 kb物理区间，这代表了一个新的MMS调控基因位点。该区域包含17个已注释的基因。序列分析发现亲本系之间存在多个SNP和Indel变异。转录组分析进一步表明，在这些候选基因中，有两个基因（BnaA06G0092000ZS和BnaA06G0092200ZS）在表现出MMS和单主茎（SMS）表型的近等基因系（NILs）之间存在差异表达。机制研究表明，由于我们的转录组数据中WUS-CLV通路核心基因的表达没有显著变化，BnaMMS可能通过干扰生长素的生物合成和分布来调控MMS的形成。我们的工作鉴定出一个控制MMS的新基因位点，并为阐明茎发育的分子机制以及培育具有优化植株结构的高产油菜品种提供了宝贵的遗传资源和理论框架。