头颈部鳞状细胞癌降解相关基因预测模型的开发及体外验证

《European Journal of Medical Research》：Development and in vitro validation of a degradation-related gene-based prognostic model for head and neck squamous cell carcinoma

　　

摘要

背景

头颈部鳞状细胞癌（HNSC）具有显著的异质性和高发病率，但明确的预后标志物仍不清楚。由于降解相关基因集导致的细胞稳态紊乱可能引发致癌过程；然而，这些基因对HNSC的发生和进展的确切贡献尚未完全阐明。

方法

本研究分析了公共数据库中的数据，以识别与患者预后相关的降解相关基因（DRGs）。随后通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和富集分析开发了一个风险模型。确定了六个与预后独立相关的基因，从而构建了一个结合风险评分和临床数据的诺模图。使用逆转录-定量聚合酶链反应（RT-qPCR）测量了HaCaT（一种正常人角质形成细胞系）和CAL27（一种人HNSC细胞系）中模型相关基因的mRNA水平。此外，还进行了包括伤口愈合和EdU掺入在内的功能测定，以探索BCL2A1在HNSC细胞中的作用。

结果

评估了不同风险组对化疗和免疫治疗的反应差异。本研究通过识别患者预后的预测特征并探索其临床适用性，阐明了降解相关基因在HNSC中的作用。体外研究证实，模型基因（ZAP70、BCL2A1、APOC1、S1PR4）在HaCaT和CAL27细胞系中的表达水平存在显著差异，表明它们可能参与HNSC的预后。额外的功能测定显示，沉默BCL2A1显著抑制了CAL27细胞的迁移和增殖能力。

结论

本研究基于降解相关基因开发了一个预后模型，并系统地评估了其临床适用性，为未来HNSC患者的预后预测和治疗策略提供了坚实的理论基础。