从先兆子痫患者的阴道拭子中通过液滴培养法分离出的新型棒状杆菌（Corynebacterium sp. nov.）的表型、基因组及功能特征分析

《BMC Microbiology》：Phenotypic, genomic, and functional characterization of Corynebacterium sp. nov. isolated by droplet-based cultivation from vaginal swabs of a preeclampsia patient

　　

摘要

背景

Corynebacterium属的细菌广泛分布于人体黏膜表面，并逐渐被认为是女性生殖道微生物群的重要组成部分。然而，由于传统培养方法的局限性，它们的多样性被低估了。

结果

在这项研究中，从一名患有先兆子痫（PE）的孕妇的阴道拭子样本中，使用基于液滴的微流控单细胞培养技术分离出一种新的细菌菌株，命名为TJG_1^T。TJG_1^T菌株被鉴定为革兰氏阳性、不产孢、非运动性的短杆菌。基于16 S rRNA基因序列的系统发育分析将其归类为Corynebacterium属，与Corynebacterium coyleae的序列相似度最高（97.39%）。全基因组测序显示其基因组大小为2,481,283 bp，G+C含量为61.52 mol%。TJG_1^T菌株与其最接近的亲属之间的平均核苷酸同一性（ANI）和数字DNA-DNA杂交（dDDH）值低于公认的物种分类阈值，支持将其归类为新物种。功能基因组注释发现了与代谢、转运系统、潜在的抗菌耐药性以及预测的宿主相互作用相关的基因。体外实验表明，在测试条件下，细菌代谢物或活细胞均未显著影响滋养层细胞的存活率或氧化应激相关基因的表达。尽管暴露于活细菌后观察到细胞迁移行为的改变，但这些变化并未伴随迁移相关基因表达的显著差异。

结论

TJG_1^T菌株代表了Corynebacterium属中的一个新物种。这项研究突显了基于液滴的培养技术在恢复以往代表性不足的阴道细菌方面的实用性，并扩展了目前对女性生殖道中Corynebacterium多样性的认识。