全基因组测序揭示了从西北太平洋黑潮延伸带分离出的Leeuwenhoekiella obamensis LY010菌株的碳水化合物降解潜力

《Marine Genomics》：Complete genome sequencing reveals the carbohydrate-degrading potential of Leeuwenhoekiella obamensis LY010 isolated from the Kuroshio Extension in the Northwestern Pacific

　　

王文豪|李阳|任高原|刘海英|刘继文

摘要

黑潮延伸带（Kuroshio Extension）是黑潮（Oyashio Current）与本州寒流（Kuroshio Current）交汇的区域，该区域具有较高的初级生产力和生物多样性，是全球生物地球化学循环的关键热点。这一独特生态系统中丰富的藻类有机物质为异养微生物提供了养分，尤其是能够降解多糖的细菌，其中以Bacteroidota门细菌为主。本研究报道了从黑潮延伸带海域采集的海水中分离出的Leeuwenhoekiella obamensis LY010的完整基因组序列及其碳水化合物降解能力。L. obamensis LY010的基因组包含一条4,067,930 bp的环状染色体，GC含量为38.63%，编码3,548种蛋白质、100种tRNA和14种rRNA。对LY010的全基因组分析发现其拥有多种具有碳水化合物降解活性的酶，包括GH92、GH43和GH2家族的糖苷水解酶，这些酶与半纤维素的降解密切相关，表明该菌具有很强的半纤维素降解潜力。这些发现为Leeuwenhoekiella属的碳水化合物降解能力以及黑潮与本州寒流相互作用对浮游微生物群落的影响提供了新的见解。