综述：综合生理、生化、代谢组学与转录组学分析揭示假单胞菌UW4通过调控植物激素增强大蒜盐胁迫耐受性

《Plant Stress》：Integrated physiological, biochemical, metabolomic and transcriptomic analyses reveal that Pseudomonas sp. UW4 enhances salt tolerance via modulating plant hormones in Allium sativum L

　　

高浓度Na+会引发严重环境问题，进一步限制作物产量并降低产品品质。本研究发现盐胁迫通过降低株高（降幅19.95%-26.55%）、叶宽（降幅24.00%-29.63%）和假茎发育（降幅7.49%-17.39%）显著抑制大蒜生长，同时通过提升活性氧（ROS，超氧阴离子O2·?最高达6909.62 μg/g/min 鲜重）水平和诱导脂质过氧化损伤细胞结构。接种假单胞菌（Pseudomonas sp.）UW4可显著提升大蒜生物量（鲜重增幅12.61%-70.55%）、根系活力（第5天增幅91.67%）、光合色素、可溶性蛋白及可溶性糖含量。该菌株能显著提高超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）、过氧化氢酶（CAT）、抗坏血酸过氧化物酶（APX）和谷胱甘肽还原酶（GR）活性，其中对POD活性的促进效应最为突出，同时提升抗坏血酸-谷胱甘肽（AsA-GSH）循环组分含量。代谢组学分析显示，UW4处理上调脱落酸（ABA）信号转导途径并提升吲哚乙酸（IAA）含量。转录组学分析鉴定到的差异表达基因主要富集于ABA信号通路（ko04075）和生长素生物合成通路（ko00380）。机制研究表明，UW4通过上调蛋白磷酸酶2C（PP2C）表达、下调pyrabactin抗性1样蛋白（PYLs）表达激活ABA信号，同时提高内源吲哚乙酸浓度。加权基因共表达网络分析（WGCNA）将PYLs关联模块与乙烯响应元件结合蛋白（EREBP）、分蘖分枝1/杯状聚伞花序/增殖细胞因子21（TCP21）及PP2C富集模块整合，共同降低氧化胁迫水平。PP2C富集模块通过同源域-亮氨酸拉链和ABRE结合因子（HD-ZIP、ABF）介导胁迫适应，这些关键转录因子同时参与油菜素内酯和ABA信号通路。亚细胞定位实验证实AsPP2C在烟草和拟南芥细胞中定位于细胞核与细胞质。YFP-AtPP2C过表达株系表现出显著盐耐受性，而UW4可进一步增强该过表达株系的耐盐能力。此外，UW4在盐胁迫下显著下调大蒜ACO基因表达水平，验证了其生物学功能。上述结果表明，UW4通过调控ABA依赖的ROS清除途径与激素稳态增强大蒜耐盐性，为盐碱农田修复提供了有效微生物策略，该环境友好型菌株适用于钠胁迫土壤以保障作物安全生产。

1. 1.
   Introduction
   全球耕地盐渍化问题日益严峻，中国土壤污染状况调查公报显示16.1%的耕地已受污染破坏。过量盐分积累会阻碍植物光合作用与叶绿素合成，破坏细胞内氧化还原稳态，导致氧化损伤并干扰正常细胞结构与功能。青海省乐都区作为“中国硒都”，是药用与食用兼用的“乐都紫皮蒜”主产区，当地充足日照为根茎类作物干物质积累提供了独特优势，但干旱少雨、蒸发强烈、大风沙尘天气加剧了土壤盐渍化，化肥农药过量施用进一步恶化了该问题。盐胁迫抑制大蒜生长发育、降低产量、退化种质，如何在保障种质稳定的前提下缓解盐胁迫危害成为亟待解决的问题。大量研究表明，植物促生根际细菌（PGPB）可通过调控宿主生理与代谢途径减轻盐胁迫损伤。现有研究显示，PGPB接种能显著降低盐胁迫下植物的丙二醛（MDA）含量，提升超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶活性，稳定光合系统，增强抗氧化酶系统功能，减少ROS积累与伤害。靶向激素代谢组定量分析可精准检测植物激素水平及代谢产物变化，目前已广泛应用于温度、涝渍等非生物胁迫响应研究，但在根茎类植物激素互作机制解析中的应用仍较少。转录组学技术已广泛用于作物抗逆机制研究，可挖掘功能基因并解析逆境响应调控网络，但单一组学难以全面阐明代谢物合成关键基因的调控机制，多组学联合分析可弥补这一缺陷，更精准解析关键功能基因的表达模式与调控逻辑。本研究整合生理生化、代谢组学与转录组学方法，解析PGPB介导的大蒜盐胁迫耐受机制，为揭示PGPB缓解大蒜盐毒害的表型生理、基因响应及植物激素调控规律提供理论支撑。
2. 2.
   Materials and Methods
   研究采用从加拿大安大略省滑铁卢芦苇根际分离的假单胞菌UW4菌株，以LB培养基培养后调整菌悬液浓度为1.0×10⁶CFU/mL用于接种。供试大蒜鳞茎经表面消毒后播种于灭菌蛭石中培育，待幼苗生长一致后移栽至含300 g灭菌蛭石的花盆，设置4个处理组：对照组（CK，蒸馏水灌溉）、盐胁迫组（SS，300 mM NaCl溶液处理）、菌株UW4接种对照组（CKP，菌悬液灌溉）、盐胁迫+菌株接种组（SSP，菌悬液溶于300 mM NaCl溶液处理），处理后0、5、10、15、20 d取样测定各项指标。农艺性状测定包括株高、叶长、叶宽、假茎粗、地上与地下部鲜重及干重，根系形态通过WinRHIZO软件扫描分析总根长、根表面积、平均根直径、根体积、根尖数及根投影面积。生理生化指标测定涵盖光合色素、可溶性蛋白、可溶性糖、抗坏血酸（AsA）、谷胱甘肽（GSH）、根系活力、超氧阴离子（O₂^?·）产生速率、MDA、H₂O₂含量，以及SOD、POD、CAT、APX、GR活性，均参照标准方法执行。植物激素检测采用LC-MS/MS平台，样品经甲醇/水/甲酸提取后定量分析8大类激素含量。转录组测序使用Illumina平台，数据经HISAT比对参考基因组，FeatureCounts计算基因表达量，通过FPKM评估表达水平，开展GO、KEGG富集分析及WGCNA共表达网络构建。分子实验部分通过Gateway克隆法构建载体，开展Western blot验证蛋白表达，利用农杆菌介导法转化拟南芥获得过表达株系，通过亚细胞定位观察蛋白分布，采用DAB染色法检测叶片H₂O₂积累情况。
3. 3.
   Results and analysis
   3.1. Plant growth and physiological response
   盐胁迫（SS）逐渐抑制大蒜幼苗生长，表现为株高降低、叶宽变窄、假茎发育受阻，而接种UW4（SSP）显著缓解盐胁迫负面影响，植株长势旺盛、叶片健壮。与SS组相比，SSP处理在5-20 d期间株高、叶长、叶宽、假茎粗分别提升19.95%-26.55%、17.12%-29.18%、24.00%-29.63%、7.49%-17.39%，其中叶宽在第20天的增幅最大（29.63%）。生理适应性方面，盐胁迫显著抑制地上部干重与根系干重积累，而接种UW4后大蒜地上部鲜重与干重在5-20 d期间分别较SS组提升12.61%-70.55%、27.59%-75.76%，地下部相应指标提升28.64%-74.81%、20.69%-48.28%。

3.2. Root indices

盐胁迫显著降低根系总根长、根投影面积、根表面积、平均根直径、根体积及根尖数，其中根尖数在胁迫第5天降幅最大（102.81%）。接种UW4的大蒜根系生长表现更优，上述指标分别提升7.67%-15.91%、-6.89%-40.71%、7.99%-14.41%、7.91%-30.16%、16.10%-23.35%、9.65%-64.79%。盐胁迫下根系活力始终低于SSP处理，SS组在第10天根系活力降幅最大（25.00%），而SSP组在第5天根系活力较SS组提升91.67%，第20天根系活力达0.47 μg/g/h 鲜重，较SS组高76.19%。

3.3. Chlorophyll contents and contents of total sugar and protein

盐胁迫显著降低叶绿素a、叶绿素b及总叶绿素含量，而接种UW4可逆转这一趋势：处理第15天，SSP组叶绿素a含量达157.63 mg/g 鲜重，较SS组提升79.06%；第20天叶绿素b含量达112.01 mg/g 鲜重，较SS组提升22.51%；总叶绿素含量在UW4处理后较SS组提升7.01%-47.27%。可溶性蛋白方面，盐胁迫下叶片与根系可溶性蛋白含量较CK组降低8.03%-32.82%、16.08%-32.81%，而接种UW4后叶片与根系可溶性蛋白分别提升29.81%-93.13%、46.78%-93.13%。可溶性糖含量在各处理第20天均达峰值，SSP组叶片与根系可溶性糖分别较SS组提升19.12%、10.97%。

3.4. O₂·^?rate of production and H₂O₂, and MDA contents

盐胁迫下大蒜叶片与根系O₂·^?产生速率在处理5天后急剧上升，SS组叶片与根系O₂·^?峰值分别达6903.85 μg/g/min 鲜重、6909.62 μg/g/min 鲜重，接种UW4后叶片O₂·^?降至5166.35 μg/g/min 鲜重，降幅33.63%，SSP组较SS组进一步降低199.67%（降至2305.77 μg/g/min 鲜重）。H₂O₂含量在0-10 d期间于SS组叶片波动于44.40-48.61 nmol/g 鲜重，最终较初始值提升234.43%，根系提升174.31%，第10天叶片与根系H₂O₂峰值分别达105.01 nmol/g 鲜重、95.02 nmol/g 鲜重；SSP处理显著降低H₂O₂积累，叶片与根系分别较SS组降低143.25%、115.51%。MDA含量在盐胁迫后期（10-20 d）快速积累，SS组叶片第15天MDA达10.99 μmol/g 鲜重，接种UW4后降低446.77%；根系第20天MDA达11.35 μmol/g 鲜重，SSP处理使其降低40.30%。

3.5. Antioxidant enzymes and ascorbic acid (AsA) and glutathione (GSH)

AsA含量在SSP处理第15天达叶片峰值13.59 mmol/g 鲜重，较同期SS组高69.24%，0-20 d期间叶片与根系AsA分别较SS组提升8.60%-86.21%、47.40%-136.00%。根系GSH含量在SSP处理第15天达峰值4.26 mg/g 鲜重，较SS组提升47.40%。抗氧化酶活性方面，SS组叶片SOD活性第20天最低，接种UW4后提升240.65%；根系SOD活性在盐胁迫第5天为70.58 U/g·FW·min，UW4处理使其提升46.34%。POD活性在根系中对早期盐胁迫响应更快，叶片则在胁迫后期（10-20 d）响应显著，SS组叶片与根系POD活性较CK组降低179.28%-395.96%、-47.34%-173.96%，SSP处理使其分别提升12.94%-565.28%、22.93%-178.19%。CAT活性在盐胁迫第5天叶片与根系分别为1303.73 U/g·FW·min、1100.00 U/g·FW·min，SSP处理使其分别提升25.92%、1.58%，第15天叶片CAT活性较SS组提升157.32%。APX活性在盐胁迫下0-10 d持续上升后逐渐下降，接种UW4后则持续升高，叶片与根系APX活性分别较SS组提升34.79%-223.33%、66.80%-238.33%。GR活性在各处理第5天达峰值，叶片与根系分别为172.00 U/g FW、139.73 U/g FW，UW4处理使其分别提升15.51%、25.38%。

3.6. Principal Component and Correlation analysis

对4个处理的38项生理生化指标进行SIMCA-P分析，前两个主成分（PC1、PC2）累计解释94.35%的总方差。得分图中SS处理与氧化应激标志物（H₂O₂、O₂·^?、MDA）聚于同一象限，证实ROS是大蒜盐损伤的关键生物标志物；SSP处理则与抗氧化防御组分（SOD、POD、APX、GR等酶活性，AsA、GSH等非酶抗氧化剂，光合色素及可溶性蛋白、可溶性糖等渗透调节物质）共定位，表明UW4可缓解氧化胁迫。聚类热图进一步验证上述结果：盐胁迫显著升高叶片与根系H₂O₂、O₂·^?、MDA水平，而UW4接种显著提升盐胁迫下的叶宽、假茎粗与根系生物量，通过上调AsA、GSH含量及SOD、POD、APX、GR活性，同时促进渗透保护物质合成，增强大蒜耐盐性。

3.7. Metabolites principal component analysis and differences in phytohormone content between treatments

激素代谢组PCA显示4个处理组间差异显著，组内3次生物学重复离散度低，实验可靠性高。聚类热图检测到8大类植物激素，其中细胞分裂素与生长素种类最丰富，分别包含16种、14种化合物，其次为5种茉莉酸衍生物、2种水杨酸衍生物，ABA、乙烯、独脚金内酯各有1种衍生物。与正常生长CK组相比，盐胁迫（SS）显著诱导ABA、色氨酸相关生长素（TRP）、水杨酸（SA）积累；盐胁迫+菌株接种（SSP）处理则显著提升ABA含量、生长素衍生物MEIAA，以及顺式玉米素-O-糖苷（CzROG）、异戊烯基腺苷（IPR）、2-甲基巯基顺式玉米素核苷（2MeScZR）、反式玉米素核苷（tZOG）等细胞分裂素组分，赤霉素衍生物GA4、GA15，SA衍生物SAG，独脚金内酯衍生物5-脱氧独脚金醇（5DS）也呈上升趋势，而茉莉酸衍生物12-氧-植物二烯酸（OPDA）呈下降趋势。K-means分析将所有差异激素按变化趋势分为9类，筛选出19种差异激素，UW4处理主要降低盐胁迫下的茉莉酸与部分细胞分裂素含量，提升ABA、赤霉素、生长素含量。

3.8. Differential phytohormone analysis and KEGG enrichment

相关性分析显示ABA与生长素（IAA-Trp、IAA）、茉莉酸（OPDA、JA、H2JA）、细胞分裂素（tZR、tZ）呈负相关，与细胞分裂素（2MeScZR、cZROG、cZR、IPR、BAPR）、赤霉素（GA4、GA15）呈正相关；生长素（IAA-Trp、IAA）与茉莉酸（JA、H2JA、OPDA）、细胞分裂素（tZR、tZ）呈不同程度正相关，IAA-Trp与细胞分裂素（cZROG、2MeScZR、DHZR、mTR、cZR、IPR）呈负相关。差异激素按含量变化分为3类，与CK相比，SS显著降低ABA、GA15、cZR、IPR含量，而UW4显著提升了盐胁迫下的ABA水平。KEGG富集分析显示，CK与SS比较时差异激素主要富集于ABA通路，SS与SSP比较时也主要富集于ABA通路（p值=0.01，倍数变化=3.25），表明大蒜通过提升ABA水平减缓盐胁迫下的生长，而UW4可进一步增强ABA响应，将更多能量导向抗盐胁迫损伤，提升植物逆境适应能力。

3.9. Differential plant hormone metabolic pathway statistics

7种关键差异植物激素关联多条代谢通路，包括色氨酸代谢（ko00380）、二萜生物合成（ko00904）、类胡萝卜素生物合成（ko00906）、玉米素生物合成（ko00908）、植物次生代谢产物生物合成（ko01060）、萜类与甾体生物合成（ko01062）、植物激素生物合成（ko01070）、次生代谢产物生物合成（ko01100）、代谢通路（ko01100）、植物激素信号转导（ko04075），其中植物激素信号转导通路（ko04075）检测到的差异激素数量最多，主要为ABA。

3.10. Differential gene filtering and functional enrichment analysis

以|log2倍数变化|≥1且FDR<0.05为标准筛选差异表达基因，CK与SS比较共鉴定到726个差异基因，其中370个上调、356个下调；SS与SSP比较共鉴定到676个差异基因，其中396个上调、280个下调。GO富集分析显示，盐胁迫下差异基因主要富集于植物激素合成相关通路，共53个相关差异基因，主要富集于激素代谢过程（GO:0042445）、激素生物合成过程（GO:0042446）；分子功能方面富集于激素结合（GO:0042562）、ABA结合（GO:0010427）等过程。接种UW4后差异基因主要富集于ABA激活的信号通路（GO:0009738）、ABA结合（GO:0010427）等过程，共66个植物激素相关差异基因，占所有差异表达基因的33.00%。K-means将差异激素相关基因按表达趋势分为10类，UW4处理主要下调盐胁迫下的2、3、4、7、10亚类基因表达，上调1、5、6、8、9亚类基因表达。KEGG分析显示，接种UW4后差异基因显著富集于植物激素信号转导与植物MAPK信号通路，其中激素信号通路富集的差异基因数量最多。

3.11. Selecting and characterizing the expression of plant hormone-related differential genes

KEGG富集到33个植物激素合成与信号转导相关差异基因，涉及ko04075、橄榄苦苷甾体生物合成（ko00905）、色氨酸代谢（ko00380）通路，其中植物激素信号通路差异基因数量最多，主要包括ABA受体基因、蛋白磷酸酶基因、生长素响应蛋白编码基因、含茉莉酸锌指结构域（ZIM）蛋白编码基因、橄榄苦苷甾体-6-氧化酶基因、吲哚-3-丙酮酸单加氧酶基因、L-色氨酸-丙酮酸转羧酶基因，其中ABA信号通路差异基因占比最高。

3.12. ABA signal transduction and IAA biosynthesis

与盐胁迫处理相比，接种UW4显著降低pyrabactin抗性1样蛋白（PYLs）活性，提升蛋白磷酸酶2C（PP2Cs）活性。盐胁迫通过抑制PYLs表达降低其对ABA的感知能力，减少PYLs与PP2Cs的结合，无法及时激活下游转录因子及其靶基因表达，导致气孔无法正常关闭、植物蒸腾作用增强，引发盐胁迫损伤；而接种菌株后PP2Cs表达显著上调，激活下游基因表达，通过降低细胞呼吸进一步提升耐盐性。生长素生物合成方面，细菌生长素（IAA）主要通过色氨酸依赖的吲哚-3-丙酮酸（IPA）途径合成：色氨酸经L-色氨酸-丙酮酸转氨酶基因（TAA1）催化生成IPA，再经黄素单加氧酶基因（YUCCA）催化合成IAA。盐胁迫显著抑制大蒜TAA1与YUCCA表达，降低内源IAA水平并导致生长抑制；而接种PGPB后TAA1与YUCCA表达显著上调，促进生长素生物合成。

3.13. Differential plant hormones and differential gene association analysis

K-means将所有差异表达激素与差异基因按表达模式分为2类：基因簇1与红色激素簇1（正相关，27个）、蓝色激素簇1（负相关，26个）表达模式一致；基因簇2与红色激素簇2（正相关，16个）、蓝色激素簇2（负相关，27个）表达模式一致。筛选相关系数大于0.8的差异基因与植物激素构建关联网络，共得到PP2C、PYL等20个差异基因与ABA、IAA等7种植物激素，其中ABA合成相关基因数量最多且相关性最强：PP2C1、PP2C2、PP2C3、PP2C4、PP2C5正向调控ABA合成与信号通路（r>0.9）；PYL1、PYL2、PYL3及木葡聚糖内转糖基酶1/4（TCH1、TCH4）正向调控ABA合成。H2JA、tZR、IAA、JA均与PP2C1、PP2C2、PP2C3、PP2C4、PP2C5呈负相关；IAA与醛脱氢酶基因（ALDH）呈正相关，与PP2C2呈负相关。综上，ABA是PGPB提升大蒜耐盐性的最关键植物激素，PP2C是其调控盐胁迫的最核心基因。

3.14. PP2Cs and PYLs regulate transcription factors

通过WGCNA分析不同处理下所有转录因子与ABA信号转导关键基因（PYLs、PP2Cs）的相关性，共鉴定到2179个可能受PYLs与PP2Cs调控的转录因子，按表达模式相似性分为16个共表达模块。相关性分析显示，PYLs与MEbrown模块呈强正相关，PP2Cs与MEturquoise模块关联最强。MEbrown模块核心转录因子包括乙烯响应元件结合蛋白（EREBP1、EREBP2、EREBP3）、TCP21、油菜素唑抗性蛋白1（BZR1）、生长素氧化双加氧酶（DOPA）；MEturquoise模块核心转录因子包括同源域-亮氨酸拉链（HD-ZIP）、未知锌指蛋白（UNK）、ABA响应元件结合因子（ABF）。PYLs通过TCP21、BZR1调控BR信号，PP2Cs通过HD-ZIP、UNK、ABF调控ABA响应，表明UW4可能通过调控核心ABA信号通路，协同调控生长素等相关通路，提升盐胁迫下大蒜的渗透稳态与胁迫适应能力。

3.15. AsPP2C subcellullar localisation and positive regulation salt tolerance

将AsPP2C-YFP与GV3101共注射烟草叶片，观察到AsPP2C-YFP与核定位标签共定位于细胞核，同时在质膜也有明显分布。构建YFP-AsPP2C #1-1与YFP-AsPP2C #7-2过表达株系，Western blot验证了AsPP2C蛋白表达；拟南芥过表达材料同样定位于细胞核与细胞质。在正常生长条件下，野生型Col与过表达株系生长势无显著差异；盐胁迫处理后，过表达株系生长显著优于Col。DAB染色显示，盐胁迫下Col叶片棕色结合区域最广，表明氧化胁迫最严重，而过表达株系棕色区域减少，说明AsPP2C可促进盐胁迫下大蒜生长。UW4处理进一步降低了拟南芥叶片ROS水平，表明UW4与AsPP2C协同增强大蒜耐盐性。生理指标量化结果显示，盐胁迫下过表达株系的株高、鲜重、干重、叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素含量均显著高于Col，进一步证实UW4与AsPP2C协同提升盐胁迫耐受性。

3.16. Strain UW4 significantly represses 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase (ACO) transcriptional level

qRT-PCR分析显示，盐胁迫显著诱导大蒜根系与叶片乙烯生物合成关键限速基因ACO的高表达：叶片中ACO在4 h、12 h、1 d、2 d、3 d均可检测到表达，12 h达峰值；根系中ACO在12 h、1 d、2 d、3 d表达显著上升，2 d达最大值。盐胁迫下接种UW4在所有检测时间点均显著抑制ACO表达，叶片抑制效应在12 h最强，根系在2 d最强，表明UW4通过转录水平下调ACO减少大蒜乙烯合成，为其促生功能提供了直接分子证据。

1. 4.
   Discussion
   植物促生根际细菌（PGPB）是一类可缓解环境胁迫、促进植物生长的有益微生物，其促生机理包括直接提升土壤养分有效性、分泌植物生长素（IAA），以及间接通过调控光合作用、激活抗氧化酶系统等生理过程增强植物抗逆性。PGPB可通过降解1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC）降低乙烯水平，这是诱导植物耐盐最有效的机制之一。本研究中UW4接种显著缓解了盐胁迫对大蒜生长的抑制，处理20天后叶宽与根尖数分别提升29.63%、64.79%，可能与菌株分泌的IAA刺激主根伸长、增加侧根数与根毛密度有关。盐胁迫下大蒜ROS积累激活了SOD、POD、CAT、GR、APX等酶促防御系统及AsA、GSH等非酶抗氧化系统，相关性分析显示UW4与SOD、POD、GR活性呈显著正相关，表明该菌株可协同激活多种抗氧化酶，同时提升AsA-GSH循环效率，通过Halliwell-Asada途径清除H₂O₂，形成抗氧化级联反应网络，增强氧化胁迫防御能力。植物激素是介导植物适应环境变化的关键内源调控因子，盐胁迫会扰乱内源激素合成与代谢，而PGPB可通过调控植物激素代谢网络帮助宿主维持激素稳态。ABA是植物非生物胁迫响应的核心信号分子，盐胁迫下快速积累于根叶组织，外源ABA可提升SOD活性、抑制MDA积累、增加渗透调节物质含量，增强抗氧化酶活性以清除ROS、减轻氧化损伤，同时促进渗透调节物质合成、降低细胞渗透势、维持膜稳定性。本研究中接种益生菌的大蒜内源ABA水平显著升高，且与植物激素信号通路密切相关，推测UW4可能激活ABA依赖的基因表达，诱导气孔关闭、降低气孔导度，限制盐分随蒸腾流进入植物体，从而提升耐盐性。RNA-seq是解析植物非生物胁迫分子机制的重要工具，本研究转录组分析显示差异基因显著富集于ABA信号通路与生长素生物合成通路，其中ABA信号级联包含3个ABA受体基因（PYL）与4个蛋白磷酸酶基因（PP2C）。ABA浓度升高时，PYL与PP2C互作抑制PP2C磷酸酶活性，释放SnRK2激酶结合ABA响应元件（ABRE）启动下游生理响应。本研究中UW4接种进一步下调PYL表达，表明该菌株可能通过调控ABA信号敏感性增强耐盐性；同时UW4显著上调PP2C表达，强化了其在耐盐调控中的关键作用。WGCNA鉴定到的2179个转录因子分为16个共表达模块，MEbrown模块与PYLs强相关，富集EREBP1/2/3、TCP21、BZR1，其中TCP参与ABA信号互作，EREBP转录因子可增强植物耐盐性，TCP21调控BR生物合成基因影响胁迫下细胞伸长，BZR1整合BR与ABA信号激活胁迫响应基因；MEturquoise模块与PP2Cs强相关，富集HD-ZIP、ABF、UNK，ABF通过结合ABRE motif激活ABA响应基因，HD-ZIP调控离子转运与地上-地下物质运输以维持Na⁺/K⁺稳态。PP2C作为盐胁迫响应的关键基因，其功能存在物种与家族成员差异，本研究中AsPP2C参与经典ABA-PYL-PP2C-SnRK2核心信号通路，但其并非主要抑制下游激酶SnRK2的转录本，因此拟南芥过表达AsPP2C表现为ABA超敏表型与耐盐性提升。上述结果系统揭示了假单胞菌UW4通过调控ABA依赖的ROS清除与激素稳态增强大蒜耐盐性的分子机制，为盐碱地生态修复与作物安全生产提供了微生物策略依据。