用于粪便微生物群移植的临床和微生物特征的集成数据集

《Scientific Data》：An Integrated Dataset of Clinical and Microbial Profiles for Fecal Microbiota Transplantation

　　

摘要

功能性胃肠疾病（FGIDs）非常普遍且具有较高的负担性，然而针对微生物群的治疗（如粪便微生物群移植，FMT）的进展受到了缺乏大规模、综合性数据集的阻碍。目前的研究在样本量和研究范围上大多较为有限，这限制了对疾病机制的深入理解以及治疗方法的精准应用。为了解决这一问题，我们建立了FMTdb，这是一个专门针对接受FMT治疗的FGIDs患者的数据集。该资源整合了来自15名经过严格筛选的长期捐赠者、370名FGIDs患者以及2,008名健康对照者的 demographic（人口统计学）、clinical（临床）和 multi-omic（多组学）微生物群数据。纵向元数据包括捐赠者的随访信息以及患者在接受治疗前后的多个时间点的观察结果。通过提供一个将微生物组成与宿主反应联系起来的多层次数据集，FMTdb为生物标志物的发现、疾病机制的研究以及基于微生物群的个性化干预措施的开发提供了坚实的基础。