在巨噬细胞登革病毒感染模型中，Nimba和Triphala介导的宿主定向抗病毒重编程的转录组特征

《Scientific Reports》：Transcriptome signature for host directed antiviral reprogramming by Nimba & Triphala in macrophage Dengue virus infection models

　　

摘要

登革热病毒（DENV）每年导致数亿例感染，但目前尚无经临床批准的抗病毒疗法，而直接作用的抗病毒候选药物则受到毒性和病毒遗传多样性的限制。传统药物如尼姆巴/印楝（Azadirachta indica）和多草药阿育吠陀制剂Triphala（由Terminalia chebula、Terminalia bellirica和Phyllanthus emblica组成）含有多种具有抗病毒和抗氧化特性的代谢物，但其作用机制尚未完全阐明。在本研究中，我们结合了基于细胞的抗病毒检测方法和转录组分析，以比较尼姆巴和Triphala在RAW264.7巨噬细胞（一种关键的先天免疫靶细胞）中对抗DENV感染时对宿主反应的影响。实验结果显示，尼姆巴和Triphala在检测浓度下具有较低的细胞毒性，这表明它们具有较好的治疗窗口。RNA-seq分析表明，尼姆巴在DENV感染的巨噬细胞中引起的转录重编程程度比Triphala更显著，NB?+?DV组与DV组相比有4,182个差异表达基因，说明尼姆巴在感染过程中对宿主转录的调控作用更强。尼姆巴增强了干扰素刺激的基因（Isg15）的表达，并减弱了炎症信号通路（如Cxcl10）、氧化应激通路（Txnip、Aox4、Phlda3）以及内质网应激通路（Trib3）的活性。相比之下，Triphala引起的基线转录重编程较为有限，且其对宿主反应的选择性更强。分子对接分析表明，Triphala相关的代谢物可能作用于多种DENV蛋白。九种DENV蛋白的分子对接结果显示，Triphala代谢物具有多靶点结合能力，其中corilagin在某些蛋白上的预测结合亲和力（ΔG ?13.9 kcal/mol）优于参考化合物（瑞德西韦和NITD008）。综上所述，这些数据支持尼姆巴对宿主反应的广泛调节作用，而Triphala则表现出更选择性的宿主反应，并可能在DENV感染过程中发挥针对病毒的作用，为利用尼姆巴和Triphala成分合成抗病毒草药制剂奠定了研究基础。