对21种口面部疾病的整合基因组分析发现，这些疾病与系统性疾病具有共同的遗传结构特征

《Nature Communications》：Integrative genomic analysis of 21 orofacial diseases identifies shared genetic architecture with systemic diseases

　　

摘要

口腔面部疾病与全身健康密切相关，但其遗传机制和因果关系尚未完全明了。通过对英国生物银行（UK Biobank）中21种口腔面部疾病进行整合基因组分析，结合全基因组、全转录组研究以及孟德尔随机化方法，我们发现了48个新的基因位点，并确定了160个潜在的致病基因。其中，ALDH1A2基因中的一个同义变异与牙周炎有关，该基因编码一种参与视黄酸合成的关键酶；CRISPR–Cas9编辑实验表明这种变异会降低该酶的翻译效率。对牙周炎组织的单细胞RNA测序进一步显示，患者的视黄酸信号通路受损，T辅助细胞17型（T helper 17）在免疫反应中占主导地位，同时龈沟液中的视黄酸水平也降低。孟德尔随机化分析证实了干燥综合征（Sj?gren’s syndrome）与肺癌和中风之间的因果关系，这一结论在FinnGen数据中也得到了验证。相比之下，龋齿和牙周炎与许多系统性疾病具有相似的遗传特征（如尼古丁相关通路的富集），但尚未发现明确的因果关系。这些发现共同勾勒出了口腔面部疾病的遗传图谱，并阐明了它们与全身病理生理学的复杂关联。