Taylorella equigenitalis和Taylorella asinigenitalis中基因组岛的初步鉴定及其在全球分离株中的分布

《BMC Microbiology》：Initial identification of genomic islands in Taylorella equigenitalis and Taylorella asinigenitalis and their distribution in isolates from around the world

　　

摘要

Taylorella equigenitalis是导致传染性马生殖道炎（CEM）的病原体，在世界多个国家呈地方性流行，影响着全球马匹的流动。该病原体在雌性马中可引发从无症状到子宫内膜炎、阴道炎以及急性不孕症等多种症状，而雄性马通常没有症状。针对这种疾病的研究主要集中在病理机制、传播动态、诊断方法以及表型和基因型特征方面。本研究的目的是建立更为全面的全球系统发育框架，并为系统中缺乏相关数据的各个主要分支生成参考质量的基因组。研究人员使用了7个此类基因组以及另外44个公开可获取的基因组数据（包括Taylorella asinigenitalis），来预测基因组中的特定区域（即基因组岛）。通过对NCBI注释的分析，发现这些基因组岛与病原体的毒力和生态适应性存在关联。此外，本研究还使用了97个T. equigenitalis和48个T. asinigenitalis的短读长序列分离株以及215个公开可获取的基因组，来研究这些基因组岛在系统发育树中的分布情况，以探讨其可能的水平传播机制。通过分析美国最近一次CEM疫情中分离出的141个分离株，评估了这些基因组岛在其自然环境中的稳定性。研究结果表明，T. equigenitalis的基因组中存在可移动的基因组岛，这些基因组岛可能对该病原体的毒力具有重要影响。