针对外显子和基因组测序中的变异进行定向反射RNA测序，可提升变异分类的准确性，从而改善患者的治疗效果

《npj Genomic Medicine》：Targeted reflex RNA sequencing for enhanced variant classification on exome and genome sequencing improves patient outcomes

　　

摘要

RNA测序（RNA-seq）已被用于提供关于剪接变异影响的功能性证据。本研究探讨了靶向反射RNA-seq在分类通过临床外显子测序（ES）和基因组测序（GS）识别出的预测剪接变异方面的实用性。对在一家医疗机构完成的连续ES/GS病例进行了回顾性分析，在这些病例中，当识别出符合条件的变异后进行了靶向反射RNA-seq检测。共有131例（占4.1%）至少报告了一个符合RNA-seq检测条件的变异，其中8例有两个独特的符合条件的变异。在139个符合条件的变异中，125个被归类为意义不明确的变异（VUS）。64例完成了靶向反射RNA-seq检测，其中27例的变异至少有一个被重新分类（占42.2%）。重新分类后，23例的结果为阳性，2例可能患有常染色体隐性遗传病。关于RNA-seq检测结果为阳性的病例的临床结局数据显示，71%（10/14）的病例临床管理方案发生了变化，43%（6/14）的病例治疗方案发生了变化。将靶向反射RNA-seq分析纳入罕见疾病的诊断流程中，可以提高变异的分类准确性，并消除对预测剪接变异的不确定性，从而预计可使临床ES/GS的诊断效率提高1.6%。