一张展示T细胞受体种系多样性的多民族参考地图揭示了α链基因上存在自然选择的证据

《Nature Communications》：A multi-ethnic reference map of T cell receptor germline diversity reveals evidence of natural selection on alpha chain genes

　　

摘要

T细胞受体（TCR）在适应性免疫中起着关键作用，然而TCR基因座复杂的重复结构阻碍了人们对编码TCR的基因中人类遗传变异的系统性研究。利用来自人类泛基因组参考联盟（Human Pangenome Reference Consortium）和“我们所有人”联盟（All of Us Consortium）的公共长读长测序数据（涵盖2719名捐赠者），我们构建了TCR V、D和J基因中常见等位基因的近乎完整的图谱，揭示了V基因中几乎每个位置的氨基酸变异情况。我们观察到许多单个TCR基因在不同人群中的等位基因频率存在差异。我们发现了TCR基因上自然选择的证据，包括α链基因座中的平衡选择和正选择信号。研究发现，TCR等位基因的多态性会改变T细胞的核心功能特性，如胸腺命运决定和细胞表面受体的数量。总体而言，这些发现表明TCR基因中的遗传变异是免疫多样性的一个关键因素，可能影响个体间的免疫反应差异。