全基因组测序显示，在喀麦隆的产科病房表面存在高风险的产ESBL（超广谱β-内酰胺酶）和碳青霉烯酶的肠杆菌目细菌

《Scientific Reports》：Whole-genome sequencing reveals high-risk ESBL and carbapenemase-producing Enterobacterales on maternity ward surfaces in Cameroon

　　

摘要

医院环境日益被认为是抗菌素耐药（AMR）细菌的重要滋生地。在撒哈拉以南非洲地区，产科病房属于高风险环境，环境污染直接威胁着脆弱的母亲和新生儿。然而，目前缺乏将表型耐药性与全基因组测序（WGS）相结合的数据，以深入了解这些环境中的抗菌素耐药性。本研究分析了从喀麦隆雅温得产科病房表面分离出的产ESBL的大肠杆菌和克雷伯菌的耐药模式和基因组特征。研究人员在四个产科病房进行了横断面环境调查。通过标准微生物学方法鉴定分离株，并根据欧洲抗菌素敏感性测试委员会（EUCAST）2024年的指南对其进行了13种抗生素的敏感性测试。利用短读长序列全基因组测序技术确定了序列类型（STs）、质粒不相容性群、抗生素耐药基因（ARGs）和毒力因子。构建了质粒-耐药基因关联网络以可视化耐药动态。共鉴定出19株产ESBL的肠杆菌科细菌，包括15株大肠杆菌和4株克雷伯菌。这些分离株对环丙沙星、青霉素类和第三代头孢菌素表现出高度多重耐药性，但对多粘菌素和亚胺培南仍保持敏感，但检测到了对美罗培南的令人担忧的耐药性。基因组分析显示存在全球广泛传播的高风险菌株，如大肠杆菌的ST131、ST1193和ST410，以及肺炎克雷伯菌的ST1324和准肺炎克雷伯菌的ST489。关键的耐药决定因子（包括ESBLs、AmpC酶和碳青霉烯酶blaNDMblaOXA-48-like）与IncF、IncA/C2和IncL/M等流行质粒相关。此外，这些分离株还携带了肠外致病性肠杆菌科细菌特有的毒力因子。产科病房表面广泛存在产碳青霉烯酶的克隆菌株，表明医院环境是雅温得地区重要的抗菌素耐药性来源。这些发现凸显了加强感染预防和控制（IPC）措施、实施严格的抗菌药物管理以及整合基因组监测的紧迫性，从而保护高度脆弱的母婴群体免受危及生命的感染。