肢端黑色素瘤的snRNA-seq分析揭示了其异质性，并找到了新的疾病进展标志物及与癌症相关的成纤维细胞亚群

《npj Precision Oncology》：snRNA-seq of acral melanoma reveals heterogeneity and identifies novel progression marker and cancer-associated fibroblasts subpopulation

摘要

肢端黑色素瘤具有较高的远处转移发生率。尽管已经对肢端黑色素瘤的基因组特征进行了研究，但不同分期病变的特征仍是需要深入探究的关键问题。我们在3个痣、7例原发性肢端黑色素瘤、4例皮肤转移灶以及3例淋巴结转移灶样本中进行了单核RNA测序分析，明确了不同的细胞亚群。在临床样本中验证了这些标记物，并通过构建敲低细胞系，在体外和体内实验中进一步确认了其功能。从17个样本中共鉴定出13种类型的细胞，通过全面分析确定了10种癌细胞亚型。分析表明Cancer cells_TGFBI可能是推动疾病进展的细胞亚群，而SERPINE2则是差异表达最显著的基因。敲低SERPINE2可显著抑制黑色素瘤细胞的生长与侵袭，并降低EMT通路的活性。与癌症相关的成纤维细胞数量位居第二。研究人员还发现了一个新的细胞群Fibroblast_TNXB，该细胞群可能与黑素细胞的分化发育存在关联。上述发现体现了肢端黑色素瘤的肿瘤异质性。SERPINE2有望成为治疗黑色素瘤的靶点，而Fibroblast_TNXB则可能与黑素细胞分化相关，为揭示肢端黑色素瘤中的新微环境相互作用提供了线索。